En enero de 1476, la fortaleza de Burgos cae en poder de los adictos a la causa de ISABEL. Poco después, FERNANDO el Católico entra en Zamora.

FERNANDO el Católico dedicado de lleno a la resolución del conflicto que ha suscitado la sucesión en Castilla, es protagonista importante en lo ámbitos diplomático y bélico en la guerra que están librando Castilla y Portugal. En el ámbito diplomático consigue la adhesión de varias ciudades y de las grandes familias. En el ámbito bélico, derrota de forma decisiva en Peleagonzalo, cerca de Toro, en la fecha, a ALFONSO V de Portugal, marido de Juana la Beltraneja, sobrina de ISabel, y parte de la nobleza castellana. La derrota aparta definitivamente del trono a Juana y la importancia de la batalla es tal que el propio FERNANDO le escribe a su esposa: Esta noche, nuestro Señor os ha dado Castilla. En conmemoración de este éxito militar, los Reyes Católicos deciden construir en Toledo el monasterio de San Juan de los Reyes.

Paralelamente se puede repeler, por el bando isabelino, el intento de invasión de los franceses por tierras guipuzcoanas, gracias ante todo al concurso de la marina vasca.