Fallece, súbitamente en la fecha, el papa GREGORIO IX. FEDERICO II está a punto de entrar a Roma cuando se entera de la muerte del papa. FEDERICO II, entonces, queda desconcertado y se pone furioso, pues ya no tiene pretexto alguno para ocupar la ciudad. Porque es un hecho histórico que todo conquistador, todo político, e incluso todo tirano, necesita un pretexto para hacer lo que hace. La muerte de GREGORIO IX ha sido la más decisiva defensa de Roma, pues es lo único que puede evitar el ataque del Emperador. Las profecías de San Malaquías se refieren a este papa como Avis ostiensis (El ave de Ostia), cita que hace referencia al hecho de que fue cardenal de Ostia antes de su elección como pontífice y al que en su escudo de armas aparece un ave.

CELESTINO IV -papa- (28.10.1241-10.11.1241). Se trata de Godofredo Castoglioni. Está enfermo y es muy anciano. Su pontificado sólo durará diecinueve días, el tercero más breve de la historia. El hecho principal de su breve pontificado tiene que ver con el cónclave que lo elige, ya que es el primero de la historia. El Colegio Cardenalicio está en ese momento formado por doce cardenales de los que sólo diez están presentes en el cónclave, debido a que los dos restantes se encuentran prisioneros en manos del emperador FEDERICO II que en esas fechas sitia Roma. Este sitio provoca una fuerte división entre los cardenales que impide que ningún candidato obtenga los dos tercios previstos por el III Concilio de Letrán, por lo que tras nueve días de deliberaciones sin llegar a un acuerdo, el senador romano Mateo Rosso Orsini ordena el encierro bajo llave («cum clavis») de los diez cardenales en el viejo palacio del Septizonio, situado en el Palatino romano con el fin de acelerar la elección e impedir que el emperador influya en la misma. Las duras condiciones del encierro, que se prolonga durante dos meses, hacen que fallezcan dos de los cardenales antes de procededer a las votaciones.

Fallece en Martirano por una caída de su caballo cuando estaba siendo trasladado a otro castillo, ENRIQUE, rey de Alemania. FEDERICO, su padre, da orden de enterrar al joven hijo rebelde en el Duomo de Cosenza, envuelto en manteles reales y con todos los honores. Un fraile menor pronuncia la oración fúnebre comentando el verseto: “Abraham empuñó la espada para inmolar a su hijo para Dios”. ENRIQUE deja dos hijos, que son privados de los derechos de sucesión como su padre. El primogénito Enrique muere en 1242, en el mismo años que su padre; y al segundo, FEDERICO, su abuelo el emperador FEDERICO II, le confiará en su testamento, el Ducado de Austria y el Marquesado de Estiria, pero nunca asumirá el gobierno de estas tierras y morirá pocos años más tarde, en 1251 o 1252, soltero y sin descendencia.

El siguiente papa no será elegido hasta dos años después ya que los cardenales, temerosos de un nuevo cónclave en las mismas condiciones que el recientemente vivido, huyen de Roma y no se reúnen hasta 1243. Es elegido INOCENCIO IV -papa- (25.6.1243-7.12.1254). Se trata de Sinibaldo de Fieschi. Este papa adopta el nombre de Inocencio porque tiene la declarada intención de seguir los pasos del gran Inocencio III, pero muy lejos estará de igualarlo. No tiene sus notables capacidades pero lo más grave no es esto sino su obsesión por el poder temporal, ya que está firmemente convencido que los papas heredan de Jesucristo el gobierno temporal de la cristiandad, junto con el espiritual. FEDERICO II ha dejado libres a los cardenales que mantenía prisioneros desde hace más de año y medio. Con ocasión de la celebración de este cónclave, FEDERICO II controla todos los alrededores de Roma, siendo de facto quién domina los Estados Pontificios. Con esta situación pretende controlar la elección papal, a lo que la mayoría de los cardenales se opone.

Elegido INOCENCIO IV, FEDERICO II envía emisarios para acordar la paz. FEDERICO II ha sido proscrito por Gregorio IX y busca a toda costa un acuerdo con la Iglesia, pero sin renunciar a su poder e influencia en las decisiones eclesiásticas. Por su parte, INOCENCIO es un hombre convencido de que el poder de la Iglesia, y en concreto de la figura papal, debe estar por encima de los gobernantes y los reyes. INOCENCIO IV exige de FEDERICO II el reconocimiento del daño que ha causado a la Iglesia. Finalmente llegan ambas partes a un acuerdo el 31 de marzo de 1244. En el mismo se restituye a la iglesia en sus posesiones, especialmente los Estados pontificios, y se libera a los prelados favorables al Papa que mantiene presos el emperador. Aunque había firmado la paz con el emperador, el papa INOCENCIO IV se siente incómodo en Italia por la presencia de la milicia imperial y decide refugiarse en Lyon con el apoyo de los genoveses.

Los dirigentes religiosos de la cristiandad que se han opuesto a una solución pacífica en Tierra Santa, sobre todo porque FEDERICO II está enemistado con el papa, han continuado las hostilidades a lo largo de los pasados años. En la fecha, las fuerzas cristianas en Palestina son derrotadas en la batalla de Gaza y, como consecuencia, solo jaffa y San Juan de acre permanecen bajo su dominio. Los carismíes al servicio de Egipto, toman Jerusalén, perdiéndose definitivamente esta ciudad para los cristianos. El régimen musulmán retorna a Jerusalén bajo los mamelucos de Egipto (1250-1517). Los cristianos y muchos judíos son masacrados. Algunos judíos escapan a Nablus y se establecen allí.

El tormento, como método para conseguir la declaración de un acusado, pasa de moda durante la que se ha dado en llamar “la Edad del Oscurantismo” (Oposición sistemática a que se difunda la instrucción entre las clases populares), y vuelve a ponerse de moda con el Renacimiento, o, más especificamente, con el resurgimiento del Derecho Romano por todo el Oeste europeo en el siglo XII. Los tribunales de FEDERICO II usan el tormento como la cosa más corriente para obtener confesiones cuando los jueces tienen motivos para creer que el preso oculta la verdad. Es natural que al declarar FEDERICO a la herejía delito capital, peor aún que lèse majesté (puesto que, dice, ofende a la majestad de Dios), se eche mano de los métodos usuales de justicia. Los tormentos empleados por lo común son el potro y la estrapada.

El tema principal del Concilio Ecuménico de Lyón (13º Concilio Ecuménico) son los delitos de FEDERICO II que está defendido en esta ocasión por su canciller Tadeo de Suessa. Se le acusa de herejía, sacrilegio, alianza con el sultán, lujuria y perjurio. FEDERICO II es declarado usurpador de bienes y opresor de la Iglesia. En la fecha, es excomulgado y depuesto prohibiendo que ningún rey lo reconozca como emperador. Tadeo de Suessa apela a una papa futuro y a un Concilio “verdaderamente ecuménico”. INOCENCIO IV, dicta la bula Agni sponsa nobilis para declarar el poder supremo de la Iglesia frente a los gobernantes. FEDERICO organiza tropas para enfretarse al papado. INOCENCIO, por su parte, pretende organizar una cruzada contra el propio emperador movilizando a los príncipes alemanes.

En la lucha de INOCENCIO IV contra el emperador FEDERICO II, el papa pretende la elección de ENRIQUE RASPE, landgrave de Turingia (Alemania central). Y aunque ha sido elegido rey rival en 1246-1247, en oposición a CONRADO IV de Alemania y, aunque llega a ser proclamado emperador del SIRG el 22 de mayo de 1246, nunca será reconocido como tal.

El papa INOCENCIO IV, provoca el alzamiento contra el emperador, FEDERICO II, de muchas ciudades del norte de Italia, obteniendo la victoria las tropas papales el 26 de mayo de 1249.