En plena elección de un nuevo papa, un grupo rival del clero elige, por su parte, a ANASTASIO el Bibliotecario. Aprovechando que la elección efectuada de BENEDICTO III tiene que ser confirmada por el emperador, los partidarios de ANASTASIO lo proclaman papa en Roma y encarcelan a BENEDICTO. Sin embargo, el apoyo popular de que éste disfruta obligan al emperador LUIS II el Joven a reconocerlo como papa, pero impone como condición para ello el que ANASTASIO sea tratado con clemencia y el que los actos de BENEDICTO se vean supervisados por el obispo Arsenio, deudo de ANASTASIO. Incapaz de imponerse a las interferencias del poder político, BENEDICTO III reclama frente a Constantinopla una jurisdicción romana propia de un primado.

Condenado ANASTASIO -antipapa- a la excomunión, es perdonado por el papa BENEDICTO III.