Perú declara la guerra a España el 14 de enero de 1866, y convence para que se le unan el Ecuador (al Norte) y Chile (al Sur).

En Ecuador, Javier Espinosa es nombrado presidente. Como Carrión, Espinosa tampoco terminaría su periodo presidencial.

En la fecha, García Moreno es elegido Presidente Constitucional  (1869-1875) y bajo su inspiración política se redacta una nueva Constitución (1869). A diferencia de la de 1861 (1861-1865) que correspondió a su primera etapa como presidente, esta Constitución o “Carta Negra”, como será llamada por sus oponentes, somete a la provincia y a los municipios a la autoridad del poder central y hace de la primera “la unidad fundamental de la división territorial del país”. Pero a más de estas disposiciones, que ya daban un enorme poder al presidente, reimplanta la pena de muerte por delitos políticos, amplía a seis años el período presidencial, contempla la reelección inmediata e impone la religión católica como condición para ser ciudadano ecuatoriano.

Terminado este segundo período, en medio de la paz y el progreso y después de haber sido elegido Gabriel García Moreno por tercera vez a la presidencia del Ecuador, es asesinado el 6 de agosto de 1875. Entre las causas de su asesinato debemos mencionar: 1. Su política autoritaria que choca con el espíritu anárquico en que había vivido el país; 2. Su política opuesta al revolucionarismo liberal; 3. El indomable afán de culturizar y civilizar al país a pasos agigantados, que chocó con la mediocridad del medio; 4. Su política de orden y rígida honradez que no se compadecía ni con la vagancia ni con la inmoralidad. Algunos jóvenes románticos liberales libertarios, como Faustino Rayo, que fue quien lo apuñaló, encarnaron la conspiración liberal.

General Leónidas Plaza Gutierrez (1/9/1901- 31/8/1905) nombrado presidente de Ecuador.

A lo largo de la primera mitad del siglo XX, Ecuador sufre diversas pérdidas territoriales a favor de los países limítrofes. Así, en 1904, pierde una zona a favor de Brasil.

Lizardo García, nombrado presidente de Ecuador (1/9/1905- 15/1/1906).

El general Eloy Alfaro Delgado, nombrado presidente de Ecuador (16/1/1906- 14/08/1911).

A lo largo de la primera mitad del siglo XX, Ecuador sufre diversas pérdidas territoriales a favor de los países limítrofes. Así, en 1922, pierde una zona a favor de Colombia.

El conflicto por el área amazónica fronteriza entre Ecuador y Perú da lugar a una guerra entre ambos países en 1941 pero es resuelto de manera favorable a Perú en la Conferencia de Río de Janeiro de 1942. En contraste con la experiencia europea de los años de principio de siglo XX, los conflictos interamericanos han sido mínimos.