El interés español por la explotación de las más que probables riquezas del mineras del Sahara originó el inicio de una serie de expediciones científicas, que comenzaron en el año 1945, si bien habrá un paréntesis en estas exploraciones en los años 1957 y 1958, como consecuencia de la guerra que tendrá lugar en esos años entre el ejército español y las Bandas Armadas de Liberación (B.A.L.) -próximas al príncipe heredero, después Hasan II- y diferentes grupos saharauis. La evolución económica y política del Sahara está directamente relacionada con el desarrollo de las diferentes expediciones investigadoras. De hecho, los naturalistas españoles son los primeros civiles en entrar en contacto con los habitantes del Sáhara, en 1945, y en llegar a lugares alejados en el interior del desierto cuyo conocimiento es prácticamente nulo. Sus logros científicos permanecerán en los círculos científicos de los naturalistas, pero no llegarán a la sociedad española

Francisco Franco decide la entrega de Tánger a una comisión internacional para que sea incorporada a Marruecos en su proceso de independencia.

En Marruecos, durante la Segunda Guerra Mundial, la burguesía y el proletariado urbano pugnan por la emancipación. Una vez terminado el conflicto, el sultán MOHAMED V (1927-1953) reclama, en la fecha, la independencia.

Los servicios del catastro español delimitan por decreto publicado, en la fecha, en el \»Boletín Oficial de la zona del protectorado español en Marruecos\» una zona tutelar entre los dominios de Ceuta y el resto del territorio marroquí. Esta zona, que ha sido llamada \»zona natural de Ceuta\» no hace mención alguna del islote de Perejil

España, desbordada por los ácontecimientos en Marruecos se ve obligada a dar el mismo paso que Francia, o sea, otorgar la independencia a su Protectorado en Marruecos. El 4 de abril de 1956 MOHAMED V, sultán de Marruecos, llega a Madrid, donde es recibido por FRANCISCO FRANCO. Asimismo es recibido apoteósicamente en Toledo, Granada, Córdoba… y se cantan las glorias de una estrecha amistad entre los dos pueblos, cimentada en viejos anales de la historia.

Para evitar la interrupción de la gestión gubernativa y administrativa y colaborar en la organización del ejército marroquí se acuerda que permanezcan en Marruecos funcionarios y militares españoles hasta principios de los años sesenta.

En el día de la fecha, se hace público un comunicado conjunto España-Marruecos en el que España reconoce el principio de independencia del Marruecos español (Rif) y la unidad del sultanato renunciando a su protectorado sobre la zona norte. España, sin embargo, se reserva las plazas de Ceuta y Melilla y los territorios de Ifni, Río de Oro y Saguía el-Harma. Rabat, que no acepta la reserva de las plazas efectuada unilateralmente por España, alega que desde este momento las plazas reservadas que siguen ocupados por militares españoles, pasan a su soberanía. Lógicamente la isla de Perejil también se encuentra incluida. Con el apoyo del régimen franquista español comienza a entrar capital extranjero con el objetivo de explotar las reservas de fosfato. La distribución de la población se altera y progresivamente se abandona la tradicional vida nómada.

En el mes de octubre Marruecos recupera de España la ciudad de Tánger.

Los marroquíes, de forma no oficial, atacan de nuevo las posiciones españolas en África, esta vez cerca de El Aaiun, capital del Sáhara español. Son detenidos una vez más, a costa de 241 muertos españoles. Los bombardeos aéreos españoles contribuyen a hacer retroceder a los asaltantes, y, de nuevo los franceses colaboran en la recuperación española.

Aunque los asaltos de Marruecos a las posisiciones españolas de Ifni y a El Aaiún no suponen por el momento una amenaza seria a los restantes territorios españoles, son indicativos de la fuerza que tienen los marroquíes y plantean serias dudas acerca del futuro. España cede el distrito de Cabo Juby en la frontera sur de Marruecos, pero el Gobierno no tiene ninguna intención de hacer más concesiones. Para fortalecer la relación de lfni y el Sáhara con España, ambos territorios reciben el estatus de provincia española el 10 de enero de 1958, siguiendo la política que ha llevado Portugal con sus propias posesiones en África. Se anuncia que se enviará a 30.000 emigrantes españoles al yermo y deshabitado Sáhara, pero no llegará a realizarse.