El 12 de mayo de 1994, Mons. Arturo Rivera y Damas, arzobispo de San Salvador, instaló el tribunal eclesiástico que instruiría el Proceso Informativo sobre la vida, martirio y fama de martirio del Siervo de Dios, Mons. Oscar A. Romero. “Se busca la canonización de Mons. Romero”, explican los documentos correspondientes, “para que las generaciones descubran en su ejemplo la integridad del ser cristiano y vivir verdaderamente la voluntad de Dios desde la perspectiva de quien se sabe hijo y lo entiende en referencia a sus hermanos, especialmente los pobres, y palpar en ellos al Señor Resucitado”. El 4 de julio de 1997, se recibió de Roma el decreto por medio del cual se aceptaba la causa como válida.

A partir de 1996, en El Salvador la economía cayó en un ritmo de lento crecimiento, acoplándose a las tendencias de las economías regionales e internacionales. La tasa de crecimiento anual desciende de un promedio de 6.1% en el período 1991-1995 a menos del 3% en el período 1996-2001. Esta situación es preocupante. De hecho, la pobreza entre la población que se dedica a actividades agropecuarias ha aumentado de 72.5% a 75.6% .

Entre 1992 y 1997, El Salvador ha experimentado mayores cambios en su sistema político que en los cien años precedentes, sin embargo, continúan latentes muchos de los problemas que dieron origen a la confrontación social y a la guerra, particularmente las enormes desigualdades sociales, la creciente pobreza y la falta de oportunidades de vida digna para la mayoría de la población, por ello es de vital importancia profundizar en el análisis de la historia que es, en definitiva, nuestra fuente más confiable de aprendizaje. En los primeros años de la década de los 90, la economía crecerá a un promedio anual de 4.5%, las exportaciones totales se triplicarán, se disminuirá el déficit fiscal y el sistema financiero se expandirá hasta convertirse en el más grande de Centroamérica. El incremento en el flujo de recursos por concepto de las remesas familiares principalmente desde EEUU., ascenderá de U$322 millones en 1990 a U$ 1,750 en 2000.

En marzo de 1997, el partido opositor FMLN obtiene una importante victoria en los comicios municipales, al ganar en la capital y decenas de ciudades provinciales. A nivel parlamentario, ARENA, con el 33,3% de los votos, conquista 28 escaños, mientras que el FMLN, con 32,1% de los votos, obtiene 27 asientos. La participación electoral alcanza tan sólo a 40% de los habilitados.

En el ámbito exterior, El Salvador soluciona, en la fecha, el conflicto territorial que tenía pendiente con Honduras, sobre la soberanía de las tres islas del Golfo de Fonseca.

El partido ARENA, vuelve a ganar las elecciones presidenciales de marzo de 1999 con el candidato Francisco Floors Perez.

En las elecciones legislativas doce meses más tarde el FMLN obtiene la mayoría necesaria para impedir que ARENA gobierne.

En El Salvador, la segunda división en el FMLN, se produce en octubre de 2001, cuando el antiguo dirigente de las Fuerzas Populares de Liberación (FPL), Facundo Guardado es separado del Frente.

Nace en El Salvador un nuevo partido: Movimiento Renovador (MR) creado pot Facundo Guardado y Francisco Jovel, otro destacado ex-líder del FMLN.

Los partidos más importantes, son: ARENA (Alianza Republicana Nacionalista): ultra derecha, actualmente en el poder. PDC (Partido Demócrata Cristiano): Demócrata. PCN (Partido de Conciliación Nacional. FMLN (Frente Farabundo Martí para la Liberación Nacional): ex-guerrilla.