Llegan tropas inglesas a Dublín para reprimir a los rebeldes irlandeses sublevados desde 1641. Las tropas de CROMWELL -el ejército de los santos- cometen las atroces matanzas de Drogheda y Wexford, que aún hoy son comentadas con horror e indignación y en las que han perecido cinco de cada seis habitantes de la isla. La emigración de católicos hacia el continente no se hace esperar. Durante cinco siglos, desde tiempos de Enrique II, el control inglés de Irlanda ha sido flojo y limitado. CROMWELL, en el espacio de cinco meses, atraviesa la isla como un torbellino, toma cada una de las fortalezas que oponen resistencia y aniquila a sus guarniciones. Cuando regresa a Inglaterra en mayo de 1650, toda Irlanda está por vez primera postrada y por fin conquistada.

CROMWELL abandona Irlanda en mayo de 1650, y al cabo de varios meses invade Escocia después de que sus habitantes hayan proclamado a CARLOS II legítimo rey de Inglaterra. Su visión de los presbiterianos escoceses es mucho menos hostil que la que tiene de los católicos irlandeses, por ello, hace una famosa apelación a la Asamblea General de la Iglesia de Escocia, urgiéndole a ver el error de su alianza con el rey, “Os imploro, por las tripas de Cristo, pensad que es posible que estéis equivocados”. Tras ser rechazado su alegato, las tropas veteranas de CROMWELL se disponen a invadir Escocia. Al principio, la campaña les va muy mal. El ejército parlamentario se encuentra al borde de la evacuación por mar desde Dunbar. Sin embargo, el 3 de septiembre de 1650, CROMWELL aplasta inesperadamente al grueso del ejército Convenanter en la Batalla de Dunbar, en la que mueren 4.000 soldados escoceses, 10.000 más cayeron prisioneros, y es capturada la capital, Edimburgo. La victoria es de tal magnitud que el propio CROMWELL considera que ha sido “uno de más señalados regalos que Dios ha hecho a Inglaterra y su gente”.

A su llegada a Escocia, el 23 de junio de 1650, CARLOS II suscribe formalmente el pacto. Su abandono del Anglicanismo, aunque le reporta apoyos en Escocia, le hace impopular en Inglaterra. Es coronado como Rey de los Escoceses en Scone (Perthshire), el 1 de enero de 1651, tras lo cual organiza una ofensiva contra Inglaterra, entonces bajo el gobierno del “Lord Protector”, Oliver CROMWELL.

CROMWELL que ha aplastado a los partidarios monárquicos en Irlanda, derrota, en la fecha, a los estuardistas, en la batalla de Worcester, en tierras de Escocia. Es la batalla final de la guerra civil inglesa. Los 16.000 soldados de las fuerzas monárquicas son aplastados por los 28.000 del nuevo ejército modelo de CROMWELL. CARLOS II huye a Francia bajo un disfraz. El Parlamento ofrece una recompensa de 1000 £ por la cabeza del rey e impone pena de muerte a cualquiera que le preste ayuda. Tras seis semanas de apuradas fugas, CARLOS II consigue abandonar Inglaterra. Empobrecido, CARLOS II recurre a España en demanda de ayuda. Intenta reclutar un ejército, pero fracasa debido a sus penurias económicas.

Muchos de los prisioneros escoceses capturados durante la campaña de CROMWELL mueren de enfermedad y otros son enviados a colonias penales en las Barbados. En las últimas fases de la campaña escocesa, los hombres de CROMWELL bajo el mando de George Monck saquean el pueblo de Dundee. Durante el período de la Mancomunidad, Escocia es gobernada desde Inglaterra y mantenida bajo ocupación militar mediante una línea de fortificaciones que sellan las sierras norteñas, que han provisto de soldados a los ejércitos de Escocia, separándolas del resto del país. La práctica del presbiterianismo es permitida, como lo ha sido siempre, pero la Iglesia de Escocia ya no tiene el respaldo de las cortes de justicia civiles para imponer sus reglas. La conquista de CROMWELL, aunque no es precisamente bien recibida, no deja ni rastro de rencor en Escocia. Aunque no se le recuerda de forma extremadamente favorable, el nombre de Oliver CROMWELL no es recibido ni de lejos con tanto odio en Escocia como en Irlanda.

La necesidad de que el ejército controle la situación provoca pronto que la República se convierta en una dictadura militar comandada por CROMWELL bajo el puritanismo intransigente. Anula la Cámara de los Lores y centra su poder en el ejército y la Cámara de los Comunes. El éxito de Cromwell se deba a que sabe mantener la paz y la estabilidad, y a que proporciona los medios necesarios para la tolerancia religiosa de grupos no católicos. La enérgica política exterior de Cromwell y los éxitos del Ejército y la Armada otorgan a Inglaterra un gran prestigio en el extranjero. Oliver CROMWELL nombra un Consejo de Estado.

El 16 de diciembre de 1653, CROMWELL da el paso final para consagrar su poder dictatorial y se nombra «Lord Protector» de Inglaterra, Escocia e Irlanda.

Oliver Cromwell envía al Caribe una expedición naval (la Western Design) comandada por el almirante William Penn y el general Robert Venables, con el objetivo de establecer en la zona una base de operaciones desde la que poder contrarrestar militarmente el auge de España en las Indias. Tras un ataque fallido a Santo Domingo, en La Española, Penn y Venables, en 1655, se dirigen a Jamaica, donde las escasas y mal armadas fuerzas del gobernador español Cristóbal de Isasi (1.500 hombres) se retiran de la ciudad de Santiago de la Vega, dejándola a los ingleses. Edward D’Oyley es nombrado gobernador.

CROMWELL y Mazarino se alían contra los españoles.

El 1657 CROMWELL, basando su decisión en un versículo de la Biblia, permite a los judíos volver a Inglaterra. Habían sido expulsados en tiempos de Eduardo I, trescientos cincuenta años antes.