En la fecha, FERNANDO II el Católico, desde la campaña de reconquista del al-Andalus, hace efectiva la sentencia contra HUG ROGER III. Acusado de crimen capital, el crimen de lesa majestad, es condenado a la pena capital, a la confiscación de todos y cada uno de sus bienes, a la privación de las dignidades, de los honores y de la fidelidad de sus vasallos. (Este proceso se trata en un manuscrito abierto por la fiscalía real contra HUG ROGER III y contra su esposa Caterina Albert que reúne un único volumen de 532 folios conservados en el Archivo de la Corona de Aragón).

HUG ROGER III participa en la invasión francesa del reino de Nápoles, en manos del rey FERNANDO II el Católico.

HUG ROGER III -último conde de Pallars-, que en el último tramo de su vida es gobernador del Castell Nou de Nápoles, es capturado en Nápoles por las tropas de GONZALO FERNÁNDEZ de Córdoba, el Gran Capitán, siendo conducido, con los grilletes puestos, a Barcelona, donde llega el 14/12/1503. HUG ROGER III sobre el que pende la pena de muerte, ve que por su avanzada edad, ésta le es conmutada por reclusión perpetua. Es trasladado a los calabozos de la prisión de Xàtiva, capital de la comarca valenciana de la Costera. Su pecado ha sido enfrentarse a la monarquía de los Trastamara: primero a la del rey Juan II y, posteriormente, a la de su hijo FERNANDO II el Católico.

HUG ROGER III muere en el mayor abandono el mes de abril de 1504. Su confesor no pudo absolverle porque no quiso perdonar: “Has de perdonar; Aquel que murió por nosotros, a los verdugos perdonó” “Yo a mis verdugos perdonaría; a los de Catalunya, jamás” (De la poesía “Lo darrer Pallars”). Con HUG ROGER III, último representante de la casa de Pallars, se acaba la estirpe condal mas duradera de la historia de Catalunya, con una trayectoria de más de seiscientos años que se ha iniciado a finales del siglo IX. Pocas páginas de gloria tiene Catalunya sin figurar en ellas algún hijo de la Casa de Pallars.