Vencida en Alemania e Italia, Austria ha de aceptar la paz, y ésta se firma en el tratado de Luneville, en Lorena, Toscana (Italia) entre Francia y el Sacro Imperio Romano Germánico, el 9 de febrero de 1801. La paz quiere aparecer como la más cumplida expresión de la voluntad de NAPOLEÓN de poner fin a la lucha armada. Pero Austria debe consentir en todas las demandas francesas: que se reconozcan como franceses los Países Bajos y los territorios en la orilla izquierda del Rin; que se confirme íntegramente el tratado de Campoformio, se reconozca la soberanía de los franceses sobre los territorios conquistados en Italia y sobre los protectorados de Holanda y Suiza. España es obligada a ceder el territorio de Luisiana al oeste del Mississippi, con lo que Francia recupera (al menos temporalmente) parte de su Imperio norteamericano, que perdiera cuarenta años antes. Con el tratado de Lunéville, Toscana (Italia) pasa del control de Austria al de Francia. Es una paz bajo el signo del orgullo y por eso contiene en sí misma las motivaciones de las guerras futuras.

Una vez eliminado el Gran Ducado de Toscana, NAPOLEÓN crea, en la fecha, por el Tratado de Aranjuez, el Reino de Etruria (se corresponde geográficamente con la actual Toscana). Estado satélite que existirá entre 1801 y 1807. En el contexto de las Guerras Napoleónicas, el duque Fernando III de Toscana es despojado por la firma del Tratado de Lunéville el 9 de febrero de 1801, si bien el país está en manos del gobierno provisional establecido por los franceses, el 27 de noviembre de 1800.

El 3 de agosto de 1801 es proclamado rey de Etruria (1801-1803) Luís I de Borbón-Parma, duque de Parma, sobrino de la reina de España María Luisa. La Isla de Elba estaba transferida a Francia pero se incorpora al reino el antiguo Principado de Piombino que fue inmediatamente por cambiados por los nombrados Presidios de Toscana.

Luís muere el 27 de mayo de 1803 y lo sucede su hijo, Luis II de Etruria (1803-1807), bajo la regencia de la viuda Maria Luisa de Borbón. El gobierno de Maria Luisa permite el asilo de algunos enemigos de Napoleón, lo que irrita a éste que suprime el reino por el Tratado de Fontainebleau el 10 de diciembre de 1807, en el cual se declara abolida la monarquía.

En 1808 el parlamento francés incorpora el territorio del Reino de Etruria a Francia. Un gobernador general, jacques François de Boussay, Barón de Menou (1750-1810) fue enviado al país y logra el poder en mayo de 1808 (hasta el 3 de marzo de 1809); se crean inmediatamente tres departamentos: departamento de Arno, departamento del Mediterráneo y el departamento de Ombrone.

Nominalmente el territorio de Etruria vuelve a ser un estado soberano en 1809, cuando es donado con título de Gran Duquesa de Toscana a la hermana de Napoleón, Elisa Baciocchi, el 3 de marzo de 1809, y se conservará hasta el 1 de febrero de 1814. La administración francesa se mantiene con los tres departamentos que ahora nominalmente formaban parte del Gran Ducado de Toscana

En febrero de 1814 el país de Toscana (Etruria) es evacuado por los franceses y ocupado por los napolitanos, y el 27 de abril de 1814 el antiguo gran duque de Toscana Fernando III será restablecido en el trono.