El duque de Alba consigue, en la fecha, la rendición de Pamplona, y aunque los franceses intentarán recuperar el reino, no tardarán en retirarse de él. La Navarra conquistada por FERNANDO el Católico queda, en un primer momento, incorporada a la Corona de Aragón.

FERNANDO el Católico otorga Testamento en Burgos por el que nombra heredero de la Corona de Aragón a su nieto FERNANDO, hermano de CARLOS. En las Cortes aragonesas existe un amplio grupo que quiere nombrar príncipe-heredero a FERNANDO, hermano de CARLOS.

Ya en el lecho de muerte, FERNANDO el Católico rectifica el testamento otorgado en Burgos en 1515, por el que nombraba heredero de la Corona de Aragón a su nieto Fernando, hermano de CARLOS. Su último testamento, por tanto, designa heredera a su hija JUANA y, cuando tenga edad para reinar y dado el estado mental de la reina, a su nieto CARLOS, pese a que el viejo rey aragonés le considera un verdadero extranjero, inadecuado para el gobierno de las Españas. Hasta que llegue este momento, nombra a su hijo natural ALONSO de Aragón regente de los reinos de la Corona de Aragón y al Cardenal CISNEROS, regente de Castilla y Navarra. Este testamento está de acuerdo con el testamento de Isabel la Católica para castilla y Navarra. Estas regencias tendrán que hacer frente a las disensiones de la nobleza, que se divide en partidarios de CARLOS de Gante, a cuyo lado se han puesto tiempo atrás como reacción a su enemistad con Fernando el Católico; en seguidores del infante FERNANDO, al que prefieren a su hermano por la educación española; y en defensores del restablecimiento del poder nobiliario.

Fallece el rey FERNANDO el Católico, en la villa de Madrigalejo (actual provincia de Cáceres), durante el transcurso de un viaje hacia Guadalupe, a la edad de 64 años. Después de su muerte, JUANA -la hija de los Reyes católicos- es reina de la Corona de Castilla y de Navarra, por su madre y además de la Corona de Aragón, por su padre; su hijo, CARLOS, le corresponderá sólo gobernar como regente, en nombre de su madre. Así, desde 1516, los documentos oficiales estarán redactados en nombre de CARLOS y de JUANA con alguna complicación a partir de 1519, cuando CARLOS, además de rey de Castilla, sea emperador. El cadáver de FERNANDO el Católico es enterrado junto al de su primera esposa, según disposición de ésta en su testamento, en la Capilla Real de la Catedral de Granada.

En la Corona de Aragón, donde desde 1481 existen los lugartenientes como sustitutos del Rey, queda en tal cargo ALFONSO de Aragón, arzobispo de Zaragoza, hijo natural de Fernando II antes de su enlace con Isabel. El lugarteniente ostenta una delegación de poderes que provoca fricciones con la Generalitat en momentos en que, además, en la propia Catalunya su máxima institución es vista a veces como un poder oligárquico que controla las finanzas no siempre en beneficio de los ciudadanos.

A pesar de que jurídicamente la Corona de Aragón sobrevivirá hasta principios del siglo XVIII (Decreto de Nueva Planta de 1716), de hecho, como entidad autónoma verá disminuir notablemente su autonomía desde 1516 al morir Fernando II el Católico, su último rey privativo. Por otra parte, contrariamente a lo que escribirán los autores románticos y nacionalistas, no parece que Catalunya haya sido ni abandonada ni arruinada por Fernando II. Bien al contrario, Catalunya se ha beneficiado de la política de Fernando. Castilla ha representado para Catalunya, la seguridad y la paz, y los catalanes no han vacilado en dirigir las cartas a Fernando II, titulándolo “Rey de España”.

En mayo, los tres estamentos del Reino de Navarra, reunidos a petición del virrey Antonio Manrique de Lara, juran fidelidad a CARLOS como su rey y señor natural. Mientras tanto, en la Corona de Aragón la situación es caótica. No hay manera de poner de acuerdo al Justicia de Aragón, a la Audiencia Real de Aragón y a la Diputación en que acepten al arzobispo Alonso de Aragón como gobernador alegando, entre otras cosas, que, según las leyes aragonesas, el cargo de gobernador sólo puede ser ejercido por el heredero al Trono. A todo ello se añade el que ninguna institución de la Corona de Aragón le reconoce a CARLOS el título de Rey hasta que no jure los fueros y libertades de los Reinos.

CARLOS de Gante, Carlos I de España y V de Alemania, es elegido rey de los dominios españoles y americanos, que recibe de sus abuelos los Reyes Católicos. Más tarde recibirá la herencia imperial, al servicio de la cual se pondrán los reinos españoles, interviniendo en las guerras de religión europeas. CARLOS I, se convertirá en España en un soberano común para una serie de territorios que, hasta el siglo XVIII, mantendrán sus propias instituciones, fueros y particularidades. De hecho hasta la llegada de los Borbones (siglo XVIII), ninguno de los soberanos de la casa de Austria -de los cuales CARLOS I es el primero de ellos- debería  considerarse formalmente rey de España, porque España como entidad política no existe todavía. El Rey no lo es del conjunto, sino de cada uno de los territorios que lo forman. De hecho, los monarcas de la casa de Austria son reyes de un sinfín de Estados. El conjunto de ellos es la llamada monarquía hispánica, cuya base esencial está constituida por los territorios españoles. Es lo que quiere decirse al hablar de “las Españas”, en plural.

Superado el escollo de las Cortes de Castilla, CARLOS I pone rumbo a Aragón donde las complicaciones también están a la orden del día. CARLOS llega a Zaragoza el 9 de mayo. Las sesiones de las Cortes de Aragón comenzarán el 20 de mayo.

En las Cortes aragonesas, tras meses de duros debates, CARLOS jura, en la fecha, los fueros y privilegios de Aragón, y las Cortes reconocen a CARLOS como rey y le otorgan un empréstito de 200.000 ducados. Después pondrá rumbo a Catalunya donde los tratos también se prolongarán en el tiempo.