CARLOS IV, creyendo que GODOY ha huido, le destituye. El gentío aplaude al rey. Pero fustigado por el hambre y el frío, GODOY sale de su escondite, siendo descubierto por los guardias del palacio y por el gentío, que de no ser por la intervención del Príncipe FERNANDO y las tropas reales hubiera sido linchado. CARLOS IV encarcela a GODOY y asustado por estos acontecimientos, abdica, en la fecha, a favor de su hijo FERNANDO VII. En Madrid y otros lugares se producen alborotos contra propiedades del caído y contra sus amigos.

NAPOLEÓN ha ido situando en España fuertes contingentes militares (unos cien mil hombres) que se adueñan prácticamente de importantes plazas estratégicas, tales como Figueres, Barcelona, Pamplona, San Sebastián. Teóricamente vienen como aliados contra Portugal cuya conquista y reparto es objeto de negociaciones. Este abuso evidente -los franceses proceden a desarmar a los soldados españoles siempre que es posible- concita contra ellos odio y resistencia más enconados que en 1794. Joaquin MURAT, cuñado de NAPOLEÓN y su Lugarteniente general en España, entra, en la fecha, en Madrid al frente de las tropas francesas, siendo bien acogido por los madrileños que le creen un protector de la causa del rey FERNANDO VII. De todas maneras, tras esta ocupación, el Gobierno español convertirá a San Fernando (cerca de Cádiz) en su sede de gobierno.

CARLOS IV, que tan sólo unos días antes ha abdicado en su hijo FERNANDO, pretende ahora -aconsejado por MURAT- invalidar la abdicación, pero FERNANDO niega todos los derechos de su padre al trono. NAPOLEÓN, consigue (obliga) que padre e hijo se reúnan, en la fecha, en Bayona a discutir el tema y dispone -«Abdicaciones de Bayona»- que salgan también de Madrid los demás miembros de la familia real. Finalmente, bajo presión de Napoleón, Fernando VII firma en Bayona su abdicación al trono de España a favor, otra vez, de su padre Carlos IV, que previamente ha cedido sus derechos a Napoleón quien, a su vez, tiene previsto proclamar rey de España a su hermano José. La ridícula pantomima fue una de las causas determinantes del rechazo español a todo lo francés, pese a lo cual la nobleza española aceptó al nuevo monarca.

CARLOS IV y GODOY salen hacia Fontainebleau y de allí a tierras italianas. FERNANDO VII parte hacia Valençay, donde permanecerá seis años vigilado. GODOY, en Italia, habiendo ya fallecido su primera esposa, se casará con su amante Pepita Tudó y ve como todos sus bienes son confiscados por el rey FERNANDO VII. Vivirá de una pequeña pensión gracias a Luis Felipe de Francia.

Esta injerencia en España de NAPOLEÓN resulta un error. El segundo de Napoleón. Su primera equivocación militar ha sido la insensata expedición a Egipto, pero sus consecuencias fueron de corto alcance y el daño pudo remediarse. Pero la aventura española fue mucho peor y, además, innecesaria. La familia real española era totalmente servil a Napoleón, pero cuando la desplazó, destapó un avispero. Tanto el rey como el Príncipe de Asturias eran unos completos incompetentes, pero esta vez el pueblo español decidió que prefería tener un rey inútil pero suyo, que otro más capacitado pero impuesto desde el exterior. Salta el «Dos de mayo» en Madrid. El pueblo de Madrid, acaudillado por los capitanes DAOIZ y VELARDE y por el teniente RUIZ, se alza contra las tropas de MURAT para oponerse a la marcha del resto de la Familia Real a Bayona. Los dirigentes de la resistencia mueren en el combate y MURAT ordena una durísima represión.

La Inquisición condena el levantamiento del pueblo de Madrid del dos de mayo considerándolo un «escandaloso tumulto del pueblo bajo».

Pronto el papa PÍO VII supone un estorbo en los planes del emperador NAPOLEÓN Bonaparte, quien en 1808 invade y ocupa Roma, obligando a las tropas del Papa a unirse a las suyas propias.

Al colaborar con los franceses las principales instituciones políticas de la monarquia, y tras el vacío de poder creado al abdicar los reyes españoles en favor de NAPOLEÓN, se abre un proceso revolucionario con la creación de las Juntas, organizaciones surgidas espontáneamente en numerosas localidades que se adueñan del poder para defender la independencia de la nación. Esta Juntas se adaptan a las regiones naturales e históricas, y sus miembros pertenecen por lo común a la burguesía local.

Los afrancesados catalanes, entre los cuales destacan las figuras de Tomàs Puig, Antoni Ferrater y Juan Madinaveytia, han apoyado a las autoridades francesas cuando éstas han ocupado militarmente el territorio del Principado. Los afrancesados ideológicos lo son por convicción. Muy influidos por las ideas de renovación de la Ilustración, creen que las reformas que introduciría la Francia de Napoleón beneficiaría al conjunto del país. Otros catalanes, sobre todo los funcionarios, colaboran a la fuerza con los franceses, puesto que tienen miedo de las represalias. Un tercer grupo de afrancesados lo representaban los «caragirats», hombres sin escrúpulos que se ponen al servicio del francés por dinero. El «caragirat» más famoso de la Guerra del Francés será el traginer de la Fraga Josep Pujol, por mote Boquica.

La abdicación definitiva de Carlos IV y los lamentables sucesos del dos de mayo madrileño determinaron el comienzo de la sublevación en el resto de las provincias españolas. Se inicia así una cruenta guerra en la que la resistencia, organizada por las Juntas de Defensa, obligó a Napoleón a mantener durante mucho más tiempo que el que había calculado un frente abierto. Zaragoza, Gerona, Valencia se fueron sumando al alzamiento. En junio Napoleón promulga la Carta de Bayona, por la que España se convierte en una monarquía constitucional gobernada por su hermano José I ( 1808-1813). Se trata de una Constitución que aboga por la libertad de prensa y los derechos ciudadanos, aunque se muestre respetuosa con la condición católica de la mayoría de los españoles. En el Madrid ocupado se instaló José Bonaparte con la intención de modernizar la ciudad aunque siempre contó con la oposición del pueblo madrileño, que le obsequió con apodos tan halagüeños como “Pepe Botella” o el “Rey plazuelas”.