NAPOLEÓN Bonaparte ha invadido los Estados Pontificios, saqueándolos y expoliándolos. Por el Tratado de Tolentino , firmado entre NAPOLEÓN y PÍO VI, el Papa cede a Francia, Aviñón y el Condado veneciano; a la república Cisalpina: Bolonia, Ferrara y Romania. Sobre el significado del Tratado de Tolentino en la historia del poder temporal de la Iglesia no son unánimes las opiniones de los historiadores. Sin embargo, el hecho de que Bonaparte no impusiera al papa ninguna cláusula sobre su papel de guía espiritual de la cristiandad representa una nueva concepción en la relación Iglesia-Estado. Con el Tratado de Tolentino la iglesia romana aceptaba, sin duda a su pesar, «el primer gran distanciamiento del poder temporal», pero «retomaba también la conciencia de disponer, según una promesa antigua, de valores eternos. Estas eran las señales de una nueva era»

Fallece en Valence-sur- Rhône, en la fecha, PÍO VI quien antes de morir ha dispuesto, en previsión de los acontecimientos, que se procediera a la elección del nuevo Papa donde y como se pudiera. Permanecerá insepulto hasta febrero del año siguiente, que lo enterrarán en el cementerio local de Valence. En 1802 sus restos serán trasladados a las grutas vaticanas de Roma. Las profecías de San Malaquías se refieren a este papa como Peregrinus apostolicus (El peregrino apostólico), cita que al parecer hace referencia a que se ve obligado a desplazarse de Roma a Valence (Francia) donde fallece. Otra explicación a la cita es la utilización durante un viaje apostólico a Austria de la divisa Peregrinus apostolicus, Viennae, 1782, aunque esto bien podría haber sido precisamente para ampararse en las Profecías de San Malaquías, ya entonces muy conocidas. Es sin embargo este un caso en que se apoyan algunos eruditos para considerar que estas “profecías” son un fraude creado para hacer ganar el papado a cierto candidato en 1592.

El Jubileo correspondiente a 1800 no se celebra a causa de los profundos cambios que involucraron el continente europeo después de la Revolución Francesa. En el año 1797 las tropas francesas ocuparon Roma y la ciudad se transformó en el centro de la República Romana. El Papa Pío VI que debería haberlo convocado, murió desterrado en el año 1799. El año que debía haber sido jubilar transcurrió entre la ausencia forzada del Papa de Roma, las difíciles condiciones políticas generales y la incertidumbre que caracteriza los tiempos de guerra. Todos estos factores impidieron a Pío VII celebrar el Año Santo, incluso con retraso.