JOSÉ I Bonaparte expulsa a la Compañía de Jesús del Reino de Dos Sicilias.

Las aspiraciones del nuevo emperador son demasiado ambiciosas como para supeditarlas a una buena armonía con el príncipe de la iglesia, por lo que la aparente avenencia entre ellos fenece tan pronto como la rígida postura papal supone un estorbo en la estrategia imperial del NAPOLEÓN Bonaparte. Es, de un lado, la negativa de PÍO VII en 1806 a sumarse al bloqueo contra Inglaterra que NAPOLEÓN quiere imponer a las naciones continentales y, de otro, la resistencia del papa ante la permanente tentativa del emperador de controlar la iglesia francesa lo que provocará la violenta reacción de éste.

La Inquisición condena el levantamiento del pueblo de Madrid del dos de mayo considerándolo un «escandaloso tumulto del pueblo bajo».

Pronto el papa PÍO VII supone un estorbo en los planes del emperador NAPOLEÓN Bonaparte, quien en 1808 invade y ocupa Roma, obligando a las tropas del Papa a unirse a las suyas propias.

En la fecha, NAPOLEÓN incorpora los Estados Pontificios a Francia, Roma incluida. El Papa, entonces, responde con la bula de excomunión «Quum memoranda». NAPOLEÓN, ni corto ni perezoso, invade el Vaticano y apresa a PÍO VII. En un carruaje con las ventanillas cerradas y tapadas, se lo lleva, atravesando los Alpes a Grenoble, después a Aviñón y por último a Savona. Los cardenales, por su parte, son obligados a trasladarse a París, para vigilarles de cerca. Prisionero en Savona, PÍO VII se mantiene firme como una roca. Se niega a aceptar una renta de dos millones de francos al año, lo que enfurece de tal forma a Napoleón que manda que le quiten todo, incluso los libros, el material de escritura y hasta el anillo.

NAPOLEÓN ocupa Roma y abre el conflicto con el Papa.

Trece cardenales, se niegan a asistir al enlace, en señal de protesta por haberse realizado el matrimonio imperial sin la previa consulta al Papa. NAPOLEÓN, con su nueva esposa de la mano, se dirige al altar para desposarse, y al mirar hacia el lado donde los trece cardenales deberían estar sentados ve que las sillas están vacías. Luego, después del desposorio, cuando esos trece cardenales deben ser presentados a la imperial pareja sentada, se le comunica al emperador que acaban de marcharse. NAPOLEÓN se encoleriza de tal suerte que amenaza con fusilarlos, por lo menos a tres, y entre ellos al gran confidente y mano derecha del Papa, el cardenal Consalvi.

Montserrat, en Catalunya, es considerada plaza fuerte por el ejército español y fortificada hasta cierto punto. Las fuerzas anglo-españolas hostilizan desde Montserrat a los franceses y estos toman terrible represalia. Los franceses, en la fecha, se presentan en Montserrat y en tres horas alcanzan todos sus objetivos militares. El mariscal Suchet otorga, como venganza, el saqueo del monasterio a sus tropas. Todo es hollado, profanado, destruido. La comunidad ha de dispersarse.

Napoleón quiso aprovechar el cautiverio del Papa para arrancarle inauditas concesiones que constituían graves atentados a la independencia de la Iglesia del poder civil. Quería, además, que se estableciese su sede en París, haciendo de la capital imperial también la del Catolicismo. Pío VII se resistió a tales pretensiones, a pesar que se le quiso forzar alejando de él a todos los prelados fieles y secuestrando su correspondencia. Napoléon quiso forzar las cosas convocando un concilio en París, al que asistieron 95 entre cardenales y prelados, que, ante su sorpresa, se declararon incompetentes para suplir la autoridad pontificia. El 6 de octubre de 1811, después de tres meses de estériles sesiones, el concilio parisino fue disuelto por un enfurecido emperador.

En la fecha, los franceses, antes de abandonar Montserrat que han destruido totalmente, incendian cuanto queda. El siglo XIX, en efecto, es especialmente trágico para Montserrat ya que debido a la Guerra del Francés, será incendiado dos veces por las tropas napoleónicas, en 1811 y posteriormente en 1812. En 1560 se inició la construcción de la basílica actual, que se consagra en 1592. Continúan las construcciones con edificios nuevos, se incrementan las propiedades y se establecen prioratos dependientes en muchos lugares. Se pone en funcionamiento una imprenta que obtiene con los años mucho renombre. Por otra parte se consigue acumular un importante patrimonio artístico. La Escolania alcanza también mucha importancia. Todo queda destruido. Ante el avance por Catalunya de las tropas francesas, la Junta se ha refugiado previamente en Solsona pasando luego a Berga. Los franceses dominan todas las plazas importantes de Catalunya. SUCHET sigue hacia Valencia con su ejército.