En 1161, en el monasterio de Fitero, el abad y fundador Raimundo es sucedido por Guillermo restableciéndose completamente la vida cisterciense en el Monasterio de Fitero.

En el siglo XII se establece en Irlanda la primera comunidad cisterciense, a la vez que la conquista inglesa dota de una cierta uniformidad a la Iglesia irlandesa. Pero el dominio de Inglaterra sobre Irlanda nunca ha sido efectivo. Con el tiempo, los señores y los caciques irlandeses recuperan casi todas sus tierras y, durante cerca de cuatro siglos, vivirán de espaldas a la evolución política, social y cultural de Europa.

En la fecha, se funda el monasterio cisterciense de Vallbona de les Monges.

Por otra parte, el Papa ALEJANDRO III encarga a los cistercienses una predicación contra los cátaros, pero sin dejar de exhortar a los nobles a tomar las armas para la defensa del pueblo fiel contra los herejes. El fundamentalismo cristiano medieval ha convertido al hereje en el máximo delincuente social. El rey recibe su autoridad de Dios; por lo tanto el hereje amenaza con su disidencia no sólo el orden religioso sino el orden civil y la estabilidad del Estado. Es natural, pues, que los reyes y los nobles colaboren en la labor de represión.

A lo largo del siglo XIII, el Císter empieza a padecer el mismo mal que Cluny: el enriquecimiento a través de donaciones acaba con la austeridad benedictina adoptada por esta comunidad en un principio.

En Alemania, la Iglesia continúa siendo una fuerza dominante en la sociedad. Los monjes cistercienses y de la Orden Premonstratense colonizan nuevos territorios en el este, mientras que la Orden de Predicadores (dominicos) y los Franciscanos predican y enseñan en las ciudades.

En el siglo XVII Citeaux pierde el control central sobre las casas extranjeras y se forman congregaciones nacionales en España y otros lugares. Por otra parte, en 1664 surge el movimeinto de la Observancia estricta que, muy pronto, se extenderá a la tercera parte de la orden en Francia aunque no en otros países. La Revolución francesa provocará la dispersión de los seguidores de la Observancia estricta a otros países. Al ser los monjes de la abadía de Trappe los primeros en regresar a Francia tras la revolución (1794), podrán establecer una cierta supremacía entre los seguidores de la Observancia estricta que en adelante serán conocidos como trapenses.s.