Es este un período de tranquilidad aparente y calma para FELIPE II. SOLIMÁN reagrupa sus fuerzas en el interior de sus dominios. En los Países Bajos se vive un tenso compás de espera. Permanecen en España RODOLFO y ERNESTO, los hijos del emperador MAXIMILIANO II. El príncipe CARLOS se entrega a difundir bulos e infamias contra su padre el rey. Se habla mal de la de Eboli y Ruy Gómez sufre en silencio las murmuraciones al tiempo que le nacen nuevos hijos, y su amigo y compañero de la infancia, FELIPE II, entristece al notar que ISABEL, la reina venida de Francia, se resigna y le resigna a no hallar descendencia.

La monarquia de los Austrias gobierna hegemónicamente bajo FELIPE II y siente como algo natural y lícito que España colonice las lejanas tierras de las Nuevas Indias en el nombre de Dios, de su rey y de los banqueros. Para SOLIMÁN, a su vez, Europa es «la América» que sueña conquistar. Los turcos, por otra parte, son señalados en los púlpitos como un castigo frente a la desobediencia de súbditos y monarcas y los españoles suponen para los indios una reencarnación de sus dioses también llegados para vengar antiguas injurias. Culturas tan distantes irrumpen con violencia más allá y más acá del Atlántico y se comportan con parecida crueldad, ansiosas de dominación, de preciados botines, de un territorio nuevo sobre el que fundar sus factorías y centros comerciales.

No será hasta 1565, con la llegada de Miguel López de Legazpi que procede de México, cuando se producirán los primeros asentamientos españoles en Filipinas.

Los nobles de Bruselas saben, por sus correligionarios en Madrid, cuando ocurren los ataques turcos, y aprovechan siempre estas ocasiones para presentar sus demandas al rey, siempre más predispuesto cuando se le suman los problemas. Pero estas concesiones no hacen variar un ápice su política. Progresivamente, a medida que las posiciones de FELIPE se recrudecen, los Estados generales van tomando un papel defensivo que implica al conjunto del país. La herejía calvinista, ya sentida por su padre, se va convirtiendo poco a poco en un problema de difícil solución. Aquí, menos que en cualquier otro punto, FELIPE II no está dispuesto a titubear o a retroceder.

Amberes es el foco de la infección protestante y la regente realiza inútiles esfuerzos para someter a todos a la voluntad última del rey. GRANVELA actúa sin necesidad de consejos ni órganos consultivos. Los condes de HORN y EGMONT y el príncipe GUILLERMO de Orange protestan ante la duquesa de Parma, MARGARITA de Austria. FELIPE II les ofrece entonces la posibilidad de ser recibidos en Madrid para oir personalmente todo lo que tengan que opinar sobre Granvela y su actividad como consejero de doña Margarita. Así, concede audiencia privada a EGMONT en Madrid. FELIPE II hace retirar los tercios estacionados en el país y destituye al odiado GRANVELA.

Desde la primavera de este año, los turcos han iniciado un ataque contra Malta. Juan PARISOT, gran maestre de la orden de Malta, orden que instituyera en Jerusalén Pedro Gerard de Martgnes en 1099, defiende la posición. FELIPE II, enterado del ataque escribe con urgencia a García de Toledo, gobernador de Sicilia, encareciéndole que, por hallarse más próximo, vele él como primero por los intereses de esta isla que debe considerar tan importante para los reinos de la cristiandad como la misma Sicilia. A continuación hace juntar una improvisada escuadra en Mesina, disponiendo que en sus territorios de Italia se recluten más de veinte mil hombres de armas listos para ser embarcados y combatir al turco en nombre de la Cruz de Cristo.

En la fecha desembarcan los soldados de García de Toledo (gobernador de Sicilia) en Malta. Los turcos suponiendo que este contingente era mayor de lo que en realidad aparentaba, levanta precipitadamente el sitio, iniciando la retirada. Los ocho mil hombres de García de Toledo y del Gran Maestre derrotan al Islam -cinco o seis veces superior- arrojando sus legiones en retirada hacia las costas. Los otomanos huyen desorganizadamente en sus naves, jurando en nombre de Alá y de sus profetas tomar venganza. FELIPE II, al saber de este trascendental triunfo de la cristiandad, envía a sus embajadores personales hasta Malta para entregar al Gran Maestre una espada y un preciado alfanje de oro y piedras preciosas como regalo, comprometiéndose a ayudar a Juan Parisot y a los caballeros de la orden con todo cuanto fuera necesario para levantar de nuevo sólidas murallas y defensas en la isla.

El gobernador de Florida, Pedro Menéndez de Avilés, funda la ciudad de San Agustín, primera población española en lo que es hoy EE.UU., y por tanto la ciudad continental más antigua de aquel país que se conserva y pervive habitada. Con ello, Pedro Menéndez cumplía las órdenes de Felipe II de eliminar los asentamientos de protestantes franceses (hugonotes) que se habían establecido junto a grupos indígenas.

Tras la toma de Vélez de la Gomera por los españoles en 1564, el Imperio Otomano intentó dar un golpe de mano tomando Malta, con la intención de que le sirviese de base para la posterior conquista de Sicilia. La resistencia heroica de los malteses detuvo a la formidable flota de Piali Pachá. El socorro de la plaza por las tropas españolas fue mérito casi exclusivo de Álvaro de Bazán, quien siguió adelante con la empresa de apoyo a pesar de la reticencia de gran parte de la corte de Felipe II.

FELIPE II firma una carta que permite la suspensión de las leyes contra la herejía, aunque rápidamente hace constar ante su notario personal que la concesión le había sido arrancada a la fuerza y, por lo tanto, en su opinión, no es vinculante.