Las actividades de la flota catalana en el Estrecho sirven de excusa a PEDRO I el Cruel que desea un enfrentamiento con la Corona de Aragón, para confiscar todos los bienes catalanes en Castilla. Se inicia la guerra con Aragón y, casi de inmediato, PEDRO I se apodera de Orihuela y Alicante. PEDRO el Ceremonioso pide ayuda a franceses e ingleses, que dirimen sus diferencias sobre Flandes y la Gascuña en la Guerra de los Cien Años.

En julio de 1358, PEDRO I el Cruel firma una alianza con Portugal para aliarse contra Aragón y para devolverse mutuamente los refugiados. Se abre una tregua. Muchos de los refugiados son asesinados por PEDRO I tan pronto regresan.

Los castellanos invaden el reino de Aragón y asolan tierras y aldeas. En algunos casos la destrucción es de tal calibre que ciertas poblaciones arrasadas entre 1359 y 1363 jamás volverán a poblarse. Otras, como Tarazona (donde la catedral sirve como establo a los caballos de los castellanos) o como Cariñena (cuyos hombres son mutilados de orejas y nariz por su enconada resistencia a los castellanos) sufren terriblemente. Una vez más, esta guerra pone de relieve el egoismo de la nobleza aragonesa y su desinterés por los asuntos del reino. Mientras las villas, ciudades y aldeas de la frontera occidental se desangran ante la ofensiva castellana, los nobles impiden o dilatan que las Cortes acuerden recursos extraordinarios para hacer frente a esa guerra, la Guerra de los Dos Pedros. El conflicto entre ambos monarcas -Pedro I de Castilla y Pedro IV de Aragón- se encuadra dentro de otros mayores contemporáneos como la Primera Guerra Civil Castellana (1351-1369) y la guerra de los Cien Años (1337-1453).

Los enfrentamientos bélicos con Castilla ocasionan enormes gastos a la Corona de Aragón. Por ello, las Cortes Catalanas de 1358-1359, convocadas por Pere el Ceremoniós y celebradas en Barcelona-Vilafranca-Cervera designan doce diputados con atribuciones ya ejecutivas en materia fiscal y unos auditores de cuentas (oïdors de comptes) que controlarán la administración bajo la autoridad del que ha sido considerado primer Presidente de la Generalitat, Berenguer de Cruïlles, obispo de Girona . Esta nueva Diputación del General ha sido considerada por algunos historiadores como el primer embrión de la futura Generalitat. Pero La Generalitat -no sólo la de Catalunya sino también la de Aragón y la de Valencia- que nace de la necesidad de las Corts Catalanes de mantener una estructura permanente que administre los impuestos pagados al rey, ha nacido ya en las Cortes de Monzón de 1289. Más bien se ratifica la institución y en 1412, Ferran d´Antequera la dotará de más poder y funciones.

Los inicios del reinado de FEDERICO III de Sicilia están llenos de guerras contra los napolitanos. En efecto, JUANA I de Nápoles, ya en 1356 se ha hecho con el control de Mesina y de Palermo, entre otras plazas, lo que acaba llevando a FEDERICO III a aliarse con Aragón mediante su boda -en la fecha- con CONSTANZA, la hija de PEDRO IV el Ceremonioso que tiene claras ambiciones sobre el reino en virtud de su casamiento con LEONOR de Sicilia y que accederá a prestarle ayuda militar, con la cual podrá hacer frente a las disensiones internas y contener el avance napolitano. De su matrimonio con CONSTANZA, nació una única hija, María.

Los aragoneses fuerzan entonces la celebración de conversaciones, que tienen lugar en Terrer (Zaragoza), donde se firma la paz el 13 de mayo de 1361. La expulsión de los exiliados castellanos, exigida por el tratado, significa una nueva matanza de PEDRO I. ENRIQUE de Trastámara tiene que refugiarse en Francia.

JAIME IV, ayuda a PEDRO el Cruel de Castilla y cae prisionero en Burgos, y aliado después con ENRIQUE de Trastámara, combate contra Aragón, con el deseo de recuperar su reino, del que sólo ha sido rey titular, aspiración que no logró ver realizada.

Se inicia la redacción de la crónica de PEDRO el Ceremonioso, la más metodológica de las cuatro grandes crónicas catalanas. Queda terminada hacia 1385

JUAN, hijo de PEDRO el Ceremonioso, como heredero de la Corona de Aragón, es nombrado lugarteniente general

En la siguiente ofensiva de PEDRO I el Cruel contra Aragón, el ejército castellano, en el que participan navarros, portugueses y granadinos, se encamina hacia el Maestrazgo, dejando tras de sí un rastro de sangre y horror. En la fecha, PEDRO I el Cruel asedia la ciudad de Valencia. Cuando esta ciudad recibe la ayuda de las fuerzas conjuntas de ENRIQUE de Trastámara y FERNANDO de Aragón (hijo de Alfonso IV y Leonor), PEDRO I se verá en la necesidad de retroceder hasta Murviedro.