La Paz de Constanza firmada entre el emperador FEDERICO I Barrarroja y el papa LUCIO III, reconoce la autonomía de las ciudades lombardas y el poder temporal del Papa, al tiempo que el emperador renuncia a la soberanía sobre los Estados Pontificios. Por la otra parte, las ciudades italianas reconocen la soberanía del emperador de Alemania. La paz de Venecia -1177- y luego la paz de Constanza -1183- sancionan los derechos y, al mismo tiempo, volverán a poner en vigor el Concordato de Worms señalando el fin del cisma.

La alianza de las ciudades de Lombardía, proporciona a FEDERICO II una excusa perfecta para no llevar a cabo la cruzada prometida. Por otra parte, pretende imponer la autoridad imperial al Papa y a las ciudades italianas del N. El papa HONORIO III -hombre enamorado del ideal de cruzada- no está dispuesto a consentírselo. Así que insiste una y otra vez en que FEDERICO II cumpla con sus compromisos. Finalmente le advierte que procederá a excomulgarlo si no lo hace. La amenaza papal es de enorme transcendencia ya que si se produce la excomunión de un soberano, sus vasallos se ven desligados del juramento de fidelidad que tienen hacia él.

La Liga Lombarda se proclama de nuevo en 1198 y 1208. En 1226, la Liga mantiene una cruenta guerra con el emperador FEDERICO II, al que logra frenar en sus intentos por poner Italia bajo su completa autoridad. Éste se gana su reputación de hábil estratega tras la toma de Vicenza y su victoria en la Batalla de Cortenuova, y se rechaza cualquier iniciativa de la Liga que no sea la rendición incondicional. A resultas de ello, Milán (que ha ofrecido una fuerte suma de oro a cambio de la paz, que Federico rechaza), Brescia, Bolonia y Piacenza ofrecen una tenaz resistencia.

FEDERICO II para mostrar al mundo entero que el Papa GREGORIO IX se ha equivocado con él, emprende, en la fecha, la sexta Cruzada, excomulgado y todo… y aunque la cruzada ha de favorecer los intereses del papado, su encarnizado rival, pero en modo alguno los suyos. Pero la excomunión es un arma terrible en manos de los papas. GREGORIO IX no responde con la absolución de FEDERICO, sino que declara que las acciones del emperador en Tierra Santa no pueden calificarse como guerra santa al continuar excomulgado, y procede a liberar a los cruzados del voto de obediencia al emperador, quien se ve obligado a regresar al conocer que el Papa, junto a la Liga Lombarda, está invadiendo su reino de Sicilia.

A las ambiciones del emperador FEDERICO II Hohenstaufen, los municipios italianos han opuesto la reconstitución de la Liga Lombarda. Ésta, en la fecha, sufre una aplastante derrota en Cortenuova y FEDERICO se muestra decidido a instalar la capital en Roma. Su idea imperial avanza, pero finalmente sucumbirá. El Papa GREGORIO IX se alía con la Liga y excomulga de nuevo a FEDERICO II. Sigue un violento conflicto. Por otra parte, el uso de armas espirituales en contiendas políticas siembra la duda en los espíritus por lo que se refiere a la doctrina teocrática.

Los Estados Pontificios vuelven a pasar por un difícil trance durante el imperio de FEDERICO II. Tras la derrota de la liga lombarda en 1239, ésta se disuelve definitivamente. Por otra parte, el Reino de las Dos Sicilias queda incorporado al Imperio. FEDERICO se propone anexionar igualmente el patrimonio de San Pedro para acaparar el dominio de toda Italia. Marcha sobre Roma, de donde se ve obligado a huir el papa GREGORIO IX, se pasea desafiante y sin oposición por toda Italia, nombra gobernador del territorio peninsular a su hijo Enzio y él mismo se erige en señor de los Estados Pontificios.

En memoria de la Liga Lombarda, un partido político italiano adopta el nombre de Liga Lombarda en 1984. Esta denominación se mantendra hasta 1991, cuando el nombre fue cambiado por el de Liga Norte (Lega Nord).