En la fecha, se firma en Perona un tratado por el cual LUIS XIII de Francia recibe bajo su obediencia y amparo el Principado de Catalunya y los condados de Cerdanya y el Rosellón, con la precisa condición de guardar sus fueros, libertades y privilegios, pasando el mariscal Brezé a ser el virrey de Francia en Barcelona. Las autoridades francesas, en efecto, respetan las instituciones catalanas, y tienen buen cuidado de que, en las principales instituciones, no puedan aparecer dirigentes ?
partidarios de España.

La Junta General de Brazos constituye una Junta de Hacienda el 13 de septiembre de 1641 que, en las semanas siguientes, tomará medidas para financiar la guerra. Por un lado, se emitirá deuda pública (censals). Por otro lado, se reorganizará el sistema fiscal, con la creación de nuevos impuestos, como el batallón, que gravará también a los privilegiados.

La Junta General de Braços constituye al mismo tiempo, una Junta de Guerra formada por catalanes y franceses bajo la presidencia del «Conseller en cap» JOAN PERE FONTANELLA con plenos poderes para organizar la defensa del Principado. Se organiza la estructura militar territorial y las compañías de almogávares. En la defensa de Barcelona se singulariza la Coronela, o milicia urbana.

En el Roselló, en el Conflent, las peticiones de ayuda a Barcelona no obtienen respuesta. Las relaciones entre Perpinyà (la segunda ciudad de Catalunya en aquellos momentos) y Barcelona, la capital, hace años que son tirantes, ya que el Roselló ha denunciado unos supuestas agravios por parte de la Diputación: abandonamiento de la defensa militar, presión fiscal asfixiante…  Ahora que también Barcelona sufre directamente las consecuencias de la ocupación francesa es impensable que pueda hacer alguna cosa para ayudarlos. A finales de 1643 el cónsul de Perpinyà se dirige directamente a los ministros de París, pero nada más reciben buenas palabras. En realidad, las instrucciones de MAZZARINO son incorporar el norte de Catalunya a la soberanía francesa. Sobre el terreno, la fortaleza militar francesa declina; los españoles han reconquistado Lleida y el Roselló hierve de indignación.

Después de tres meses de asedio, Lleida capitula ante las tropas castellanas en julio de 1644. Las tropas del rey FELIPE IV, entran en Lleida el 6 de agosto y, al día siguiente, en la fecha, FELIPE IV renueva en esta ciudad su juramento de fidelidad a las libertades y constituciones catalanas, prometiendo que estos derechos no se verán afectados por la rebelión del Principado, y la posterior sumisión de la Diputació al monarca francés. FELIPE IV, opta en lugar de la venganza por atraerse a la población. Este gesto real tiene un alto valor simbólico y contribuye a aumentar el número de catalanes partidarios del retorno a la monarquía hispánica.

Para cubrir el efecto negativo de la derrota de Lleida, el virrey de Francia en Catalunya, La Motte, asedia Tarragona. Sin embargo, el ejército real con la colaboración ya de algunos catalanes que se han pasado al bando español le obligan -en la fecha- a levantar el asedio. Caído en desgracia, el virrey La Motte dejará el virreinato de Catalunya dos meses después.

Paolo del Rosso (de Cerdenya). Decano de Barcelona. Negociará una alianza secreta con Francia. Es nombrado president de la Generalitat de Catalunya (1650-1654).

En 1651 la Diputació de Catalunya, que estaba en Manresa, decide volver a la obediencia de FELIPE IV; pero, a pesar de ello, Barcelona prefiere resistir el asedio que acaba de iniciarse. La defensa de la ciudad es organizada por la Coronela y dirigida por el Consell de Cent. La extensión de la peste (que sólo en Barcelona se cobra 16.000 víctimas) contribuye a abatir los ánimos.

Es nombrado virrey de Catalunya (1653-1656) JUAN JOSÉ de Austria, hijo natural de FELIPE IV. Había sido uno de los generales victoriosos y el que había llevado a cabo las negociaciones para la rendición de Barcelona (1652). Inicia en seguida una política de atracción de la población que consigue algunos éxitos entre la burguesía de las ciudades litorales. A pesar de eso, se muestra inflexible en asuntos de gobierno, como el control real de las insaculaciones. Desde Barcelona empieza el golpe de estado que derroca al valido JUAN E. Nithard, confesor de la reina, aunque ?
no consigue el control del gobierno hasta los años 1676-1679.

Como continúa la guerra con Francia (1635-1659) y es por tanto necesaria la presencia de tropas en suelo catalán, el virrey apela al buen sentido de los catalanes para que no se creen problemas. Logra que la Diputació y el Consejo de Ciento colaboren a los gastos de manutención de las tropas. Se granjea la estima de los catalanes, especialmente de la burguesía del litoral.