El 31 de octubre, Barrón y Monasterio en su camino hacia Madird, alcanzan Parla y Valdemoro.

En noviembre del 36 el gobierno republicano se traslada a Valencia debido a la situación crítica y al riesgo de que la capital caiga en manos de los sublevados, creándose en Madrid la Junta de Defensa presidida por el general Miaja e integrada por representantes políticos y sindicales republicanos. Esta Junta sustituye al gobierno y al ayuntamiento, y se encarga de la defensa de la ciudad y de diversos aspectos de la vida ciudadana.

En noviembre de 1936 , el cardenal Isidro Gomá interpreta como máxima autoridad de la iglesia española el sentido de la guerra en «El caso de España», texto muy difundido por todo el mundo, sólo superado por la Carta colectiva del Espiscopado español, de la que fue principal redactor (y que fue suscrita por todos los obispos españoles excepto por dos, que expresamente no quisieron hacerlo: Vidal y Barraquer, cardenal de Tarragona, y Mateo Múgica, obispo de Vitoria). Además, entre diciembre de 1936 y octubre de 1937, será representante confidencial y oficioso de la Santa Sede ante el Gobierno del general Franco.

En Madrid, muchos quintacolumnistas están ocultos realizando trabajos encubiertos para no revelar sus simpatías por el enemigo. Otros están escondidos en viviendas, de las que no salen para evitar ser descubiertos y represaliados. Y otros se emboscan como francotiradores que disparan sus armas sobre los milicianos desde azoteas, balcones o ventanas. A estos últimos se les conoce como «pacos», por el sonido de los disparos que efectúan con sus fusiles (algo parecido a «pac»). Las actividades de los «pacos» se conocen como «paqueo». Sus disparos son respondidos por el fuego de los milicianos. Muchos «pacos» son apresados y ejecutados en el momento, otros son detenidos y encarcelados, y otros muchos pasan a engrosar las filas de los enviados a las «checas» para ser interrogados.

El día 2 de noviembre, en una acción conjunta, ya encima de Madrid, se alcanza la línea Móstoles- Fuenlabrada- Pinto. Brunete cae en manso de las fuerzas nacionales.

El día 3 de noviembre de 1936, las tropas franquistas ya están en los arrabales de Madrid dando comienzo a un cerco que se mantendrá hasta el final de la guerra. En la capital de España hay muchos simpatizantes de los sublevados que tratan, desde el interior de la ciudad, de desestabilizar la situación y facilitar la entrada de las tropas franquistas. El general MOLA dice entonces una frase, que luego será repetida por Franco, referente a una «quinta columna», término que se hará célebre y será utilizado a partir de entonces para referirse a algo muy específico. MOLA dice que Madrid está rodeado por cuatro columnas militares, más una quinta columna que se encuentra en el interior de la capital y que asaltará la misma desde dentro. Se denominará quintacolumnistas, desde entonces, a los partidarios del bando franquista que se encuentran escondidos en territorio republicano y trabajaban para los sublevados.

Francisco LARGO CABALLERO forma el XXIV Gobierno de la República (4/11/1936-17/5/1937). Realiza una serie de reajustes en su Gabinete con el fin de dar cabida en el mismo a los anarquistas, que ocupan cuatro ministerios. Entre ellos se encuentra Federica Montseny, en el de Sanidad. Por primera vez en la Historia de España colaboran ministros anarquistas, socialistas y comunistas.

La población de Madrid, decidida y enardecida, está convencida de que los franquistas no pasarán. Pero Largo CABALLERO mejor informado y menos confiado, considera que poco es lo que se puede hacer desde el interior de una ciudad asediada, por lo que el 6 de noviembre, toma la decisión de trasladar el Gobierno de la República a Valencia. Rápidamente los principales ministros y funcionarios comienzan el traslado. La decisión no tiene igual acogida en todos los sectores; la CNT, por ejemplo, es muy crítica con la medida por considerar que supone dejar abandonado Madrid a su suerte y que afectará de forma importante a la moral de los combatientes republicanos. El gobierno republicano que se ha desplazado a Valencia ha dejado encargado al general MIAJA la defensa de la capital. MIAJA está auxiliado por una Junta de Defensa en la que predominan los comunistas. La capital de España resistirá hasta el final de la guerra.

Las tropas franquistas comienzan ya a penetrar por Carabanchel y la Casa de Campo. La proximidad de las fuerzas enemigas y la posibilidad de que puedan entrar en la capital hace que salten todas las alarmas y terminen por desatarse las mayores barbaridades. Hay una gran preocupación por los miles de presos afines a los insurgentes, que se encuentran en las cárceles madrileñas y que, en caso de ser tomada la capital, pasarán a engrosar las filas del bando contrario, por lo que se decide su traslado hacia lugares bajo control republicano, como es el caso de Valencia. Los durísimos combates registrados en la Casa de Campo y en la Ciudad Universitaria, han mermado considerablemente a las divisiones franquistas, que no se arriesgan al asalto frontal.

La operación de traslado del oro del Banco de España a Algameca termina el 6 de noviembre. Se han trasladado 10.000 cajas con unas 560 toneladas de oro. Más tarde se enviarán valores, billetes y los depósitos de plata.