También en la Corona de Aragón se fortalecen las atribuciones de los lugartenientes generales, lo que resulta lógico debido a los largos períodos de ausencia del rey FERNANDO de los territorios de la Corona de Aragón.

En la Corona de Aragón, debido a la tradición pactista, le resulta más difícil al poder monárquico potenciar las instituciones centrales de gobierno. A fin de liquidar el papel político de las principales instituciones del país y también para acabar con las prebendas y complicidades creadas en torno a los cargos de diputado, FERNANDO II impone la insaculación a la Generalitat (1493) y al Consell de Cent (1498). La insaculación es un sistema de elección de los cargos consistente en introducir los nombres de los candidatos en una bolsa (o en un saco) y escogerlos al azar. FERNANDO se reserva para el resto de su reinado la posibilidad de controlar qué nombres pueden ser ?insaculados y cuales no. De esta manera se liquida cualquier forma de oposición política organizada desde las instituciones del país. No es necesario decir, sin embargo, que nada más una minoría muy selecta tendrá la posibilidad de poder ser inscritos entre los que han de salir elegidos. (Será el mismo sistema que impondrá Felipe IV cuando conquiste Barcelona durante la Guerra dels Segadors (1652)

El Consell de Cent tiene un organismo ordinario de consell i de govern, que desde 1387 estaba formado por treinta miembros del propio Consell. A partir de 1455 pasaron a ser 32 personas, y desde 1493 son 36 sus componentes.

La cuarta bula concedida por el papa ALEJANDRO VI a los Reyes Católicos está fechada el 3 de julio: La Eximiae Devotionis, otra bula menor, por la cual se daban a los Reves Católicos en sus territorios los mismos privilegios otorgados a los Reyes de Portugal en los suyos.

Ni que decir tiene que COLÓN está convencido de que ha llegado al continente asiático. En cualquier caso rápidamente comienzan los preparativos de un segundo viaje que parte de Cádiz el 25 de septiembre de 1493. En esta ocasión participan 17 navíos y más de mil expedicionarios, provistos de los elementos necesarios para llevar a cabo en las Indias una labor de colonización. Durará hasta el 11 de junio de 1496.

La quinta bula concedida por el papa ALEJANDRO VI a los Reyes Católicos está fechada el 26 de septiembre: la Dudum Siquidem, igualmente bula menor, también llamada de ampliación de la donación, porque amplia la concesión de la primera Inter Coetera, señalando inequívocamente que serán para los castellanos las tierras que haya hacia la india.

Ante la amplitud territorial de la Corona de Castilla y la enorme cantidad de trabajo que se acumula en la Chancillería de Valladolid, los Reyes Católicos deciden, en la fecha, crear una segunda Chancillería. Su sede es fijada en Ciudad Real (aunque en 1505 será trasladada a Granada) y su jurisdicción comprende los territorios situados al sur del Tajo.

En los dibujos de la época difícilmente veremos a Colón desembarcando en América sin un fraile a su lado. Pero sólo en el segundo viaje los ha llevado. Son trece frailes de la orden de los mínimos de San Francisco de Paula. Cuando Colón llega a La Española (actual Santo Domingo) encuentra que el asentamiento de La Navidad ha sido arrasado y eliminados sus habitantes. Colón inicia de inmediato, un segundo asentamiento, La Isabela, más hacia el Este, que se convertirá  en punto de partida de las expediciones posteriores hacia el interior en busca de metales preciosos, a pesar de la resistencia indígena. En el trazado de la ciudad no falta el lugar para el templo en el que se oficia la misa por primera vez en América el 6.1.1494. Es entonces cuando Fray RAMON Pané, Fray Juan de Duela y Fray Juan Tisín se adentran en la selva para empezar la evangelización en tierras del cacique Guaticagua. Los Reyes Católicos dan a la conquista un gran sentido religioso. Envian a los misioneros «para que conviertan a los indígenas a nuestra santa fe católica», con la advertencia de que «se les trate amorosamente».

Pronto comienzan a organizarse otros viajes a las tierras recien descubiertas. Se les denomina «menores», participando en ellos preferentemente marinos originarios de la Corona de Castilla, como Alonso de Ojeda, Juan de la Cosa, Vicente Yáñez Pinzón, etc. El resultado del descubrimiento significa, entre otras muchas cosas, que de inmediato se inicia una gran mezcla biológica. Colón lleva caballos a las nuevas tierras, y trae piñas a Europa.

Tratado de Tordesillas: El monarca portugués JUAN II, no acepta la línea papal de demarcación -y esto demuestra que no existe la teoría del dominus orbi- y empieza una negociación diplomática entre Castilla y Portugal. Juan II propone que en vez de un meridiano se trace un paralelo, reservando a los portugueses la zona austral y dejando la septentrional para los españoles. Los REYES CATÓLICOS insisten en el meridiano y ofrecen correrlo más hacia el oeste: hasta 250 leguas e incluso 350 desde Cabo Verde, pero JIAN II sigue empeñado en que es necesario llevarlo más lejos, lo que hay que aceptar al fin. Se acuerda colocarlo a 370 leguas al oeste de Cabo Verde. El convenio se plasma en el Tratado de Tordesillas, firmado el 7 de junio de 1494. Las tierras descubiertas o que se descubran al oeste de dicha línea serán castellanas, y las situadas al este de la misma serán portuguesas. La nueva línea permitirá la ocupación de Brasil por parte de Portugal. El empeño del rey de este país por conseguir el paralelo, o al menos un meridiano tan alejado de Cabo Verde, se interpretará lógicamente como consecuencia de haber descubierto ya el Brasil, pues no se explica de otra manera.