Si España no puede contar, en el siglo XVI, con una burguesía poderosa y dinámica, no es solamente a causa de la política seguida por los Reyes Católicos hacia los judíos; otras circunstancias históricas actúan en el mismo sentido: la organización del mercado de la lana, orientado hacia la exportación, que lleva a España al subdesarrollo, la conquista del nuevo mundo que prolonga más allá de los mares los métodos y las mentalidades medievales, más tarde, la política imperial y la quiebra del espíritu burgués.

PABLO IV utiliza eficazmente la institución de la Inquisición para reprimir las infiltraciones de luteranos y reformistas en los reinos de Italia. En su celo, llega a investigar incluso a miembros señalados del Colegio Cardenalicio: el cardenal Giovanni Morone, el cardenal inglés Reginald Pole. Los judíos sufren también el severísimo talente de gobierno de PABLO IV, que los hace objeto de su bula Cum nimis absurdum publicada el 18 de julio de 1555 y que supone la creación del gueto en Roma, el despojo de sus propiedades y su reducción a la condición de esclavos, obligándolos a llevar una señal distintiva, sombreros amarillos para los hombres y velos o mantones para las mujeres, trato que, según él, merecían por su intervención en la muerte de Jesucristo.

El papa PÍO V financia con cargo al erario pontificio la participación de la Iglesia en las guerras santas en Francia contra los hugonotes, o la expulsión de los judíos de los estados de su jurisdicción.

El empeño de FELIPE II de que no quede nada en España que se aparte del puro catolicismo, le induce a volverse contra los musulmanes que aún habitan el país y que se han convertido al catolicismo. Mantienen su cultura y tradiciones (religión aparte) y se denominan «moriscos». El rey también sospecha de los judíos que han abrazado el catolicismo, a los que se llama «marranos». En ambos casos se les atribuyen prácticas secretas de sus anteriores religiones. En 1568, la situación con los moriscos -que son más numerosos que los marranos- ha llegado a ser tan intolerable que Aben Humeya, guerrero morisco, cuyo nombre cristiano es Fernando de Córdoba y Válor (1520-1568) se rebela contra FELIPE II e inicia, en la fecha, la guerra de las Alpujarras, sesenta y nueve años después de la primera. Es reconocido como rey de Granada y Córdoba. Las fuerzas de Juan de Austria la liquidarán expeditivamente.

El 1657 CROMWELL, basando su decisión en un versículo de la Biblia, permite a los judíos volver a Inglaterra. Habían sido expulsados en tiempos de Eduardo I, trescientos cincuenta años antes.

Judíos vieneses fundan, en la fecha, la primera comunidad judía en Berlín.

En Palma de Mallorca, los descendientes de los judíos conversos, conocidos con el nombre de chuetas, sufren, en la fecha, una nueva persecución propiciada por los poderosos, como tantas otras veces, para desviar la tensión motivada por problemas sociales. En este pogrom intervienen tanto elementos de la población común como las autoridades. Estos chuetas viven en el barrio del Call de Palma desde 1391, año en que obtuvieron permiso del gobernador para asentarse en él desde el resto de las Islas Baleares. Su participación en la expansión marítima de las islas les convierte en un grupo poderoso económicamente y, por ello, centro de atención del malestar social.

En el primer tercio del siglo XVIII, la Inquisición en España dio rienda suelta a la última gran persecución contra los judaizantes (Entre 1721 y 1731 se celebrarán 70 autos de fe). Luego, su labor represora se centrará en combatir las ideas de las Luces y amordazar el pensamiento ilustrado. El siglo XVIII será una época de ilusiones desbaratadas por la nobleza y la Iglesia mediante el largo brazo de la inquisición.

LUIS XVI conocido por el rey «cristianísimo», es el primero que reconoce los derechos de los judíos y su plena nacionalidad francesa, en 1787. De forma análoga, es él quien suprime la prohibición del culto protestante, que se remonta a LUIS XIV.

Los judíos dispersos por el mundo mantienen la unidad y el rigor de su religión y sus tradiciones, que tienen sus fundamentos en la lejana y perdida tierra de Israel, a la que se siguen considerando unidos. El fundamento mismo del judaísmo es una indisoluble trilogía: Dios-Pueblo-Tierra. La destrucción del Templo y la dispersión ahondan más la conciencia de la Ley y la memoria de Sión en la vida religiosa y las instituciones haciendo que el recuerdo de Palestina permanezca como una realidad viva en la colectividad judía disgregada por el mundo, aunque unida por un sentimiento común.