El Papa GREGORIO V en agradecimiento a OTÓN III lo corona emperador, en la fecha, declarándolo protector de la Iglesia. Pese a todo, el Papa no logrará que OTÓN III le haga entrega de la Pentápolis. OTÓN III sólo cuenta 16 años (el papa tiene 24 años). OTON III aspirará nada menos que a la dirección de la cristiandad de Occidente. Esto equivale, de cara a los soberanos vecinos, a un primado moral que es aceptado en general (los más reticentes serán los reyes de Francia). Con el Papado, en cambio, tal ambición conduce a un inevitable conflicto, en el que los emperadores llegarán al agotamiento y los príncipes alemanes se aprovecharán para afirmar su autonomía. Perseguidos por la quimera imperial, los reyes alemanes serán en definitiva cada vez menos «dueños de su territorio», a diferencia de sus vecinos franceses.

A partir de OTÓN III, los emperadores alemanes se denominarán «Romanorum imperator augustus». Puesto que Teófano, madre de OTÓN III, es una princesa bizantina y reconoce la desigualdad entre el título de basileus (del emperador germano) y el de basileus romanion (del emperador bizantino), añade la palabra romanorum en su intitulación para elevar la categoría de su hijo el emperador, frente al emperador bizantino Basilio II, que no es pariente suyo. Los emperadores subsiguientes seguirán mencionando su carácter romano para afirmar la supremacía de su posición cesaropapista frente a la hierocracia papal.

Tras la coronación de OTÓN III se celebra el concilio de Pavía en el que resultan condenados al destierro los cabecillas de la rebelión contra Juan XV, entre ellos CRESCENCIO Nomentano, jefe de la familia Crescencio, aunque dicha pena es posteriormente conmutada por intercesión del papa GREGORIO V.

ARNULFO permanece encarcelado hasta que tras la muerte del rey Hugo I es liberado y restaurado en su dignidad arzobispal.

En 997, BOLESLAO I el Bravo organiza la expedición misionera del obispo Adalberto de Praga a las tribus boruscias y, asesinado el misionero, compra sus restos mortales, los sepulta en la catedral de Gniezno y aprovecha la canonización del mártir para elevar el rango de Polonia. La coyuntura política internacional, aunque de corta duración, propicia este plan.

El papa GREGORIO V sólo cuenta con el apoyo imperial ya que el pueblo romano no acepta un papa extranjero rigiendo los destinos de la Iglesia; por lo que, aprovechando que OTÓN III ha vuelto a Alemania y que el papa se encuentra en la Lombardía, CRESCENCIO NOMENTANO, con el apoyo bizantino, nombra papa, en la fecha, a Juan Filigato, un obispo de origen griego, que toma el nombre de JUAN XVI (4.997 – 2.998). Un nuevo antipapa.

Romualdo, futuro fundador de los camaldulenses, tras entrar en la abadía de San Apolinar en Classe (Italia) es, en la fecha, elegido abad.

Ante la proclamación del antipapa JUAN XVI, OTÓN III, como antes lo hicieran sus antecesores, llega a Roma, depone al antipapa, y ordena que le arranquen los ojos, le corten la lengua, las orejas, los labios, la nariz y las manos luego lo paseen sobre un asno por las calles de Roma. Después de esa humillación lo deporta al monasterio de Fulda en Alemania donde fallecerá en 1001. Por otra parte, OTON III ejecuta a CRESCENCIO Nomentano y a sus principales seguidores. Liberado momentáneamente de la permanente amenaza de los Crecencio, GREGORIO V puede atender los asuntos de la Iglesia, impulsando la reforma monástica, imponiendo una penitencia de siete años al rey ROBERTO de Francia por haberse casado con BERTA, a la que la unen lazos de consanguineidad. Intenta recuperar para el papado el prestigio perdido.

Fallece ADELAIDA. Emperatriz del Sacro Imperio (969-973) y santa. Hija del rey de Borgoña, esposa primero de Lotario II de Italia (947), ha casado en segundas nupcias con el emperador Otón I (951). Ha desempeñado la regencia durante la minoridad de su nieto Otón III (991-994) (Fiesta el 16 de diciembre).

Romualdo que ha sido elegido abad de la abadía de San Apolinar el año anterior, considera que la vida no es suficientemente rigurosa, y en 999 se retira a los pantanos cercanos para llevar una existencia más austera.