Ante la amplitud territorial de la Corona de Castilla y la enorme cantidad de trabajo que se acumula en la Chancillería de Valladolid, los Reyes Católicos deciden, en la fecha, crear una segunda Chancillería. Su sede es fijada en Ciudad Real (aunque en 1505 será trasladada a Granada) y su jurisdicción comprende los territorios situados al sur del Tajo.

En los dibujos de la época difícilmente veremos a Colón desembarcando en América sin un fraile a su lado. Pero sólo en el segundo viaje los ha llevado. Son trece frailes de la orden de los mínimos de San Francisco de Paula. Cuando Colón llega a La Española (actual Santo Domingo) encuentra que el asentamiento de La Navidad ha sido arrasado y eliminados sus habitantes. Colón inicia de inmediato, un segundo asentamiento, La Isabela, más hacia el Este, que se convertirá  en punto de partida de las expediciones posteriores hacia el interior en busca de metales preciosos, a pesar de la resistencia indígena. En el trazado de la ciudad no falta el lugar para el templo en el que se oficia la misa por primera vez en América el 6.1.1494. Es entonces cuando Fray RAMON Pané, Fray Juan de Duela y Fray Juan Tisín se adentran en la selva para empezar la evangelización en tierras del cacique Guaticagua. Los Reyes Católicos dan a la conquista un gran sentido religioso. Envian a los misioneros “para que conviertan a los indígenas a nuestra santa fe católica”, con la advertencia de que “se les trate amorosamente”.

Tratado de Tordesillas: El monarca portugués JUAN II, no acepta la línea papal de demarcación -y esto demuestra que no existe la teoría del dominus orbi- y empieza una negociación diplomática entre Castilla y Portugal. Juan II propone que en vez de un meridiano se trace un paralelo, reservando a los portugueses la zona austral y dejando la septentrional para los españoles. Los REYES CATÓLICOS insisten en el meridiano y ofrecen correrlo más hacia el oeste: hasta 250 leguas e incluso 350 desde Cabo Verde, pero JIAN II sigue empeñado en que es necesario llevarlo más lejos, lo que hay que aceptar al fin. Se acuerda colocarlo a 370 leguas al oeste de Cabo Verde. El convenio se plasma en el Tratado de Tordesillas, firmado el 7 de junio de 1494. Las tierras descubiertas o que se descubran al oeste de dicha línea serán castellanas, y las situadas al este de la misma serán portuguesas. La nueva línea permitirá la ocupación de Brasil por parte de Portugal. El empeño del rey de este país por conseguir el paralelo, o al menos un meridiano tan alejado de Cabo Verde, se interpretará lógicamente como consecuencia de haber descubierto ya el Brasil, pues no se explica de otra manera.

Los Reyes Católicos consiguen formar la Liga Santa con el destronado rey de Nápoles, el papa Alejandro VI y el emperador, contra el monarca francés Carlos VIII, que recientemente había tomado la ciudad del Vesubio.

Los Reyes Católicos se preocupan por reforzar la posición de Castilla y León en el campo internacional y uno de los medios empleados son los enlaces dinásticos. Por ello, deciden en la fecha, casar a sus hijos e hijas con herederos de las familias reinantes. En consecuencia, se acuerdan los enlaces matrimoniales de los hijos de los Reyes Católicos, D.JUAN y Dña. JUANA, con los de MAXIMILIANO de Austria, la princesa MARGARITA y el archiduque FELIPE el Hermoso (habidos con MARÍA de Borgoña), si bien no se celebrarán estos matrimonios hasta 1496 el de Dña. Juana y hasta 1497 el del príncipe JUAN.

JUANA, hija de los Reyes Católicos, se casa con FELIPE el Hermoso -hijo del emperador Maximiliano I-, en la colegiata de San Gumaro de la ciudad de Lierre. Previamente, en agosto, lo ha hecho por poderes, en Valladolid, según el acuerdo alcanzado por sus respectivos padres en 1495. Los Reyes Católicos no tienen hijos varones que hereden sus Estados. Obviamente, si a aquella pareja le nace un hijo, un Habsburgo reinará en Austria, los Países Bajos, España y los otros países que Austria y España dominan en Europa, por no hablar de los crecientes dominios españoles en América. Parece que los dos esposos se quieren mucho, al menos en los primeros tiempos. Luego FELIPE se apartará de su mujer y reanudará las relaciones que mantenía con varias queridas. Esta situación llenará de desesperación y celos a JUANA que no se sentirá a gusto en aquellas tierras creyéndose cercada de rivales y espías. Preferirá quedarse sola muchas veces, fuera de toda compañía, sin participar en las fiestas palaciegas. Entonces comenzará a mostrar cierta propensión a la melancolía y a la vida retirada.

Por la bula “Si convenit” expedida por el Papa BORGIA, ALEJANDRO VI, el 19 de diciembre de 1496, es concedido a los reyes de España, Fernando e Isabel el título de Católicos (a los reyes franceses se les aplica el título de Cristianísimos). Las razones que el Papa invoca para la concesión del título son: 1. La liberación de los estados pontificios y del feudo papal del Reino de Nápoles, invadidos por el rey Carlos VIII de Francia (también Cristianísimo). 2. Las virtudes personales de ambos Reyes manifestadas en la unificación, pacificación y robustecimiento de sus reinos. 3. La reconquista de Granada de manos del Islam. 4. expulsión de los judios que no hubiesen aceptado el bautismo en 1492. 5. Por los esfuerzos realizados por ambos monarcas en intentar llevar adelante la cruzada contra los mahometanos. (El título de «Católico» se volvió a dar a Carlos V en 1517, después de lo cual quedó incorporado al uso diplomático y de las cancillerías.)

El 22 de julio de 1497, en Medina del Campo, ISABEL y FERNANDO, proclaman la primera Pragmática contra la sodomía del período inicial de la edad moderna. La Pragmática de 1497 agrava significativamente los discursos y las sentencias y penas decretadas contra los sospechosos de sodomía. Las descripciones que hace de la práctica sodomita la conciben como un crimen y también como un pecado, más que como un peligro para el estado español. Proponen que tanto \”la ley secular como la eclesiástica unan sus fuerzas para castigar el crimen nefando, ese que no merece tener nombre, destructor del orden natural y por tanto punible por la justicia divina\”. En teoría, las leyes sobre la sodomía habían existido antes de 1497. En concreto en el Fuero de Sepúlveda y los Fueros Reales: \”De los sodomitas […] Mandamos que cualesquiera que sean que tal pecado fagan que luego […] ambos dos sean castigados ante todo el pueblo e despues a tercer día sean colgados por las piernas fasta que mueran\” (Fuero Real, Libro IV, Titulo IX. Citado en F. Tomás y Valiente: \”El crimen y pecado contra natura\”, pág. 39). Sin embargo, en la práctica, las autoridades rara vez las ponían en práctica como hicieron Fernando e Isabel ya en el siglo XVI.

En Salamanca, en la fecha, muere de unas fiebres súbitas, el príncipe don JUAN, heredero de todos los dominios de los REYES CATÓLICOS. Deja a su mujer, MARGARITA de Austria, en estado, pero la princesa sufrirá un aborto que malogrará su descendencia. Los planes de los reyes católicos se ven seriamente transtornados. Los derechos sobre el trono pasan a ISABEL, primogénita de los REYES CATÓLICOS, ahora reina de Portugal, por estar casada con MANUEL I, rey de Portugal.

Véase Cronología

Al dar a luz un hijo varón, MIGUEL de la Paz, fallece ISABEL, primogénita de los REYES CATÓLICOS, casada con MANUEL I rey de Portugal -Manuel de Braganza- y jurados príncipes de Asturias. El derecho a la Corona de Castilla, León y Portugal pasa, en consecuencia al hijo de ISABEL, MIGUEL de la Paz.