Un hecho que no ha tenido ningún precedente y no ha vuelto a producirse nunca más tiene lugar en Catalunya durante la Guerra Civil de 1462-1472: Catalunya tiene dos Diputaciones. Pocos meses después de comenzar la guerra, en enero de 1463, el diputado militar Bernat SAPORTELLA huye de Barcelona y se establece en Tarragona. Consigue que JUAN II lo reconozca como diputado único de Catalunya y le otorgue todos los poderes que tienen los tres diputados reunidos. SAPORTELLA ejerce el cargo de diputado único hasta 1470. (No es necesario decir que la Diputación prosigue su actividad).

ENRIQUE IV, a quien el nombramiento de rey o señor de Catalunya le interesa sólo en la medida en que cree poder debilitar a su enemigo y al partido aragonesista activo en Castilla, no cuenta con la habilidad de JUAN II, que contraataca avivando la guerra civil en el reino castellano. Finalmente, convencidos ambos monarcas de la inutilidad de una estrategia que les perjudica mutuamente, se avienen a aceptar el arbitraje de LUIS XI de Francia, que dicta una sentencia (Bayona, 23 de abril de 1463). ENRIQUE IV renuncia a los reinos de Catalunya y Navarra y por lo tanto se aviene a abandonar a los catalanes y a devolver a JUAN II posiciones navarras ocupadas por sus tropas; JUAN II, por su parte, hará concesiones semejantes en Castilla. Para ENRIQUE IV lo que era una magnífica oportunidad se ha convertido en un fracaso total. Sólo ha servido para demostrar lo nefasto que puede resultar un gobierno regido por los deseos de una nobleza que no piensa más que en sus propios intereses.

JUAN II el Grande, tratando de asegurarse la fidelidad de los otros reinos de la Corona y asegurar la posición política de su heredero, nombra a FERNANDO, en la fecha, virrey de Aragón.

Después de la renuncia de ENRIQUE IV, la corona de Catalunya es ofrecida a PEDRO de Portugal el Conestable que es, en la fecha, proclamado rey (PEDRO IV de Catalunya) (1463-1466). Hijo del infante PEDRO de Portugal y de ISABEL, hija de Jaime II de Urgell.

JUAN II, obtiene de los sicilianos el reconocimiento explícito de la primogenitura de su hijo FERNANDO

La inesperada muerte del condestable PEDRO de Portugal, conde de Barcelona, podría haber acelerado el fin del conflicto, pero la Generalitat de Catalunya ofrece los títulos de la Corona de Aragón a RENATO I de Nápoles o de Provenza o de Anjou el Bueno (1466-1472) que cuenta con el apoyo de LUIS XI de Francia, quien sueña con anexionarse Catalunya y por ello, retiene la posesión del Rosellón y la Cerdanya. En la fecha, acepta la corona. Continúa la guerra en Catalunya contra JUAN II de Catalunya-Aragón. RENATO d’Anjou no se traslada a Catalunya. Envía tropas francesas y napolitanas dirigidas por su hijo, JUAN de Lorena y su nieto, JUAN de Calabria, que se instalan en Perpinyà para activar la campaña en nombre del nuevo rey. La crisis económica alcanza una magnitud como nunca hasta ahora se había sufrido.

Fallece en Tarragona, la esposa de JUAN II, madre de FERNANDO II de Catalunya-Aragón, JUANA Enríquez.

Los éxitos de las fuerzas extranjeras y catalanas contrarias a su autoridad hacen mella en el ánimo de JUAN II de Aragón, pero el monarca es un hombre endurecido por la política y avezado a la lucha. La experiencia y la necesidad de preparar el futuro de su heredero le empujan a contraatacar. Lo hace en el plano diplomático, pactando con Inglaterra y Borgoña para aislar a Francia en la escena internacional y recabando ayuda de las Cortes de Aragón y Valencia para continuar la guerra: otra apuesta política es el nombramiento, en la fecha, de su hijo FERNANDO como rey de Sicilia (10/6/1468 – 23/1/1516), que da cierta satisfacción al autonomismo siciliano y realza el prestigio del príncipe en el momento en que conviene acelerar los acuerdos para su matrimonio con ISABEL de Castilla.

La Generalitat acaba doblegándose a los designios de la monarquía autoritaria del rey JUAN II. Éste entra en Barcelona el 23/10/1472 mostrando, en la magnanimidad que pocos esperan, toda su enorme capacidad de prudencia. El rey jura que respetará las leyes de Catalunya a pesar de sus ideas absolutistas. Declara que los barceloneses han sido leales súbditos, pero no perdona al conde de Pallars que le ha hostigado de continuo y que ha conseguido huir.

Al acabar la Guerra Civil catalana, la nobleza encabezada por la casa de Cardona, firman la capitulación de Pedralbes y asume un papel de sumisión ante la monarquía. Nada más el conde de Pallars, HUG ROGER III, presenta resistencia a los propósitos del rey. HUG ROGER III, acorralado por sus enemigos y muy endeudado, se atrinchera en su guarida de las montañas, desde donde concibe el sueño de un estado pirenaico, una unidad de territorio desde el Valle d’Aran hasta la sierra del Montsec (al sur de Pallars Jussà) y desde la Ribagorça hasta el Segre. La desigualdad de fuerzas y una desfavorable política internacional, hunden el proyecto. HUG ROGER III inicia sus ataques contra los nobles vecinos para unificar sus territorios.