Pese a la tregua establecida entre el rey JAIME I y la nobleza de Aragón, Pedro Ahonés se dispone a a atacar al rey, pero es asesinado por caballeros de la casa de JAIME I. Se desencadena, por ello, una nueva acometida de la nobleza aragonesa en contra del monarca. Pero esta vez JAIME I cuenta ya con un ejército y con el apoyo de los catalanes. Se enfrenta a los nobles y, con paciencia y prudencia, consigue dominar a sus enemigos y, no sin muchas concesiones, volverles a su obediencia.

Pese a un temporal, algunas naves de las que se han dirigido a Mallorca, llegan a la Palomera el día 9/9 y otras el 10/9 en Santa Ponça, mientras que el grueso de la flota entra en Portopí el 12/9, desde donde después de librar violentos combates, se inicia el asedio de la ciudad de Mallorca, Madina Mayurca.

Mallorca resiste durante tres meses. Poco después un poderoso de la isla proporciona al rey JAIME I víveres y medios para resistir, a la vez que su influencia, hasta que todas las partidas de Mallorca quedan al servicio del rey JAIME. La ciudad es conquistada al asalto por JAIME I el 31/12/1229. La resistencia en otros puntos de la isla durará, sin embargo, dos años, siendo exterminada, expulsada o reducida a esclavitud la población autóctona de las islas. Así, pues, en Mallorca, el elemento musulmán posterior a la conquista será muy escaso.

Tal como ha quedado establecido en las Cortes de Barcelona de 1228, JAIME I se reserva la mitad del territorio. El monarca la repartirá entre su familia, los templarios, los funcionarios reales y las ciudades que han intervenido en la empresa (Barcelona, Tarragona, Marsella, Lleida, Girona, Besalú…). La otra mitad de la isla se repartirá entre grandes magnates catalanes y estos a su vez la repartirán entre sus vasallos respectivos. JAIME I decide crear en Mallorca un reino nuevo e integrarlo en la Corona de Aragón. La isla será repoblada con contingentes traídos de Catalunya -principalmente de l’Empordà- y Occitania. Estas gentes, dejarán allí su peculiar habla dialectal ampurdanesa llamada “salat” por el hecho de que en vez de utilizar los artículos “la”, “lo”, utilizan el artículo femenino “sa” (masculino, “es”). Por otra parte, se concede a los barceloneses el práctico monopolio del comercio con las islas.

Pasado el verano de 1230, el rey decide volver a Catalunya, dejando en Mallorca como lugarteniente a Bernardo de Santa Eugenia, señor de Torrella. A los tres días de haberse hecho a la vela, en la Palomera, las galeras de D.JAIME arriban a la Porrasa, entre Tamarit y Tarragona.

El papa GREGORIO IX se dirige al arzobispo ASPARGO de Tarragona diciéndole que la Santa Sede tiene conocimiento de que la herejía cátara ha penetrado en varias diócesis españolas y exhorta a dicho arzobispo y a sus sufragáneos los obispos, a que se opongan al proceso del error buscando y haciendo buscar a los herejes y sus partidarios conforme a las disposiciones de su bula de este mismo año. El arzobispo de Tarragona contacta con el provincial de los dominicos, RODRÍGUEZ de Villares, cuyas funciones se extienden a los cuatro reinos cristianos de la Península -Castilla, Corona de Aragón, Navarra y Portugal-, y le encarga que designe los religiosos de su orden que juzgue más idóneos para el empleo de inquisidor. Dicha bula es también remitida al obispo de LLeida que al punto la manda ejecutar en su diócesis, donde se establece la primera inquisición española.

En la fecha, queda instituido el Tribunal de la Inquisición en Barcelona en virtud del Breve dirigido el año anterior por GREGORIO IX al arzobispo ASPARGO, de Tarragona, en el que se le manda que para evitar la propagación de la herejía cátara proceda contra los favorecedores, defensores y ocultadores de los herejes. Poco a poco se irá introduciendo en la Corona de Aragón. Castilla, León y Andalucía cristiana como tienen escasísima relación con el sur de Francia de donde viene a Aragón la doctrina de los cátaros y valdenses no es necesaria la erección de tribunales constantes para los raros casos que en estos reinos ocurren. La Inquisición catalana tenía un funcionamiento muy especial sobre todo por lo que respecta a su actuación con los judíos. No hay constancia, o al menos no la hemos encontrado, de ninguna condena a muerte por el tribunal de la Inquisición en Catalunya desde la época de Jaime I hasta los Reyes católicos.

JAIME I realiza un tercer viaje a las islas para eliminar los nucleos rebeldes de las montañas y, además, para someter a Menorca a la condición de tributaria. En efecto, consigue el vasallaje del alcaide de Menorca, Abu Abd Allah Muhammad, por el cual es respetado. (En el reinado de Alfonso II el Liberal, Menorca será definitivamente conquistada)

JAIME I trata de encender los ánimos a la gente y preparar un ejército en primavera, que le permita dirigir la primera campaña, cuyo destino es Burriana. Así, en la fecha, preside una reunión de Cortes en Monzón donde se arbitran medidas para la conquista de Valencia. Aunque la iniciativa es aragonesa, los catalanes son imprescindibles en una lucha que tendrá indudablemente su vertiente marítima. JAIME I autoriza a los nobles aragoneses que entretanto prosigan por su cuenta la reconquista valenciana.

JAIME I de Aragón promulga en Zaragoza, varias constituciones que tienen que ver con la persecución a los herejes. JAIME I actúa con asistencia y consejo de seis Obispos, de los Maestros del Templo y del Hospital, de muchos abades y otros prelados. Uno de estos decretos, dice: “En los lugares sospechosos de herejía, un sacerdote o clérigo nombrado por el Obispo, y dos o tres laicos elegidos por el Rey o por sus vegueres y bailes, harán inquisición de los herejes, con privilegio para entrar en toda casa y escudriñarlo todo, por secreto que fuese. Estos inquisidores deberán poner inmediatamente sus averiguaciones en noticia del Arzobispo u Obispo y del vicario o baile del lugar, entregándole los presos”.