La ocupación francesa de Rosellón durante 30 años y las múltiples invasiones francesas de aquellos territorios hacen ver a FERNANDO de Aragón la endeblez de la frontera catalano-francesa. Para reforzarla, dispone en este año la construcción de la fortaleza de Salses, cuya obra duró seis años. La fortaleza de Salses, obra del ingeniero RAMÍREZ, fue la fortaleza más importante de aquellos tiempos.

El 22 de julio de 1497, en Medina del Campo, ISABEL y FERNANDO, proclaman la primera Pragmática contra la sodomía del período inicial de la edad moderna. La Pragmática de 1497 agrava significativamente los discursos y las sentencias y penas decretadas contra los sospechosos de sodomía. Las descripciones que hace de la práctica sodomita la conciben como un crimen y también como un pecado, más que como un peligro para el estado español. Proponen que tanto \»la ley secular como la eclesiástica unan sus fuerzas para castigar el crimen nefando, ese que no merece tener nombre, destructor del orden natural y por tanto punible por la justicia divina\». En teoría, las leyes sobre la sodomía habían existido antes de 1497. En concreto en el Fuero de Sepúlveda y los Fueros Reales: \»De los sodomitas […] Mandamos que cualesquiera que sean que tal pecado fagan que luego […] ambos dos sean castigados ante todo el pueblo e despues a tercer día sean colgados por las piernas fasta que mueran\» (Fuero Real, Libro IV, Titulo IX. Citado en F. Tomás y Valiente: \»El crimen y pecado contra natura\», pág. 39). Sin embargo, en la práctica, las autoridades rara vez las ponían en práctica como hicieron Fernando e Isabel ya en el siglo XVI.

El 4 de agosto de 1498 FERNANDO el Católico firma con LUIS XII, el sucesor de Carlos VIII, el Tratado de Marcoussis, concluyendo así definitivamente la Primera Guerra italiana (1494-1498)

Al dar a luz un hijo varón, MIGUEL de la Paz, fallece ISABEL, primogénita de los REYES CATÓLICOS, casada con MANUEL I rey de Portugal -Manuel de Braganza- y jurados príncipes de Asturias. El derecho a la Corona de Castilla, León y Portugal pasa, en consecuencia al hijo de ISABEL, MIGUEL de la Paz.

FERNANDO e ISABEL, tras la muerte del Gran Inquisidor, Tomás de Torquemada, podrían haber renunciado al proyecto de dar sucesor al inquisidor y abolir la inquisición, pero se apresuran a proponer al papa al dominico Diego DEZA como continuador (1498-1507). Apenas comienza sus funciones cuando despliega tanta o más severidad que Tomás de Torquemada, redactando unas ordenanzas que de más actividad al tribunal, añadiendo también varios artículos referentes a la confiscación que es el objeto de constante atención para el rey y el Santo Oficio.

ISABEL la Católica, obliga a entrar en el convento de agustinas de Madrigal a dos hijas naturales del rey, llamadas María y Mª Esperanza de Aragón.

FERNANDO II de Aragón y LUIS XII de Francia firman en 1500 un tratado reservado (el Tratado de Chambord-Granada) repartiéndose el reino de Nápoles, adjudicando al francés las provincias de Labor y los Abruzos, con los títulos de rey de Nápoles y de Jerusalén y el español el resto, con el título de duque de Pulla y de Calabria.

La muerte de ISABEL (1498), esposa del rey de Portugal, MANUEL I, y la de su único hijo, MIGUEL de la Paz (1500), anticipa la posibilidad de que MANUEL I, viudo, joven y poderoso, pueda celebrar un nuevo matrimonio que perturbe la alianza hispano-portuguesa, fundamental para la política europea de FERNANDO el Católico. Así que el soberano español decide componerle el enlace con la única soltera que queda en la familia -MARÍA- que tiene dieciocho años y es sumamente agraciada. MANUEL I de Portugal acepta enseguida la oferta ya que también a él le importa mantener el bloque ibérico. El 20 de mayo es firmado el acuerdo y el 24 de agosto se celebra, por poderes, la boda, justo cuando se cumplen dos años de la muerte de la princesa ISABEL.

Para la boda entre MARÍA -hija de los Reyes Católicos- y MANUEL de Portugal, es necesaria la dispensa pontificia, que ALEJANDRO concede, tras el habitual tira y afloja, del que obtiene las inevitables ventajas familiares. En la fecha, entra MARÍA en Portugal, el país donde reinará, con el acostumbrado séquito que preside el cardenal Mendoza. El soberano la espera en Alcaçer de Sal; allí se casan, para llegar a Lisboa en Noviembre. Este matrimonio hecho a contrapelo, resulta después el único dichoso de todos los contraídos por las hijas de los REYES CATÓLICOS. MARÍA y MANUEL tendrán mucha descendencia. MANUEL I, fallecida María, se casará con una nieta de los Reyes Católicos: LEONOR de Austria.

LUIS XII de Francia, más realista que su antecesor, Carlos VIII, llega a un acuerdo con FERNANDO el Católico. En efecto, el «Tratado de Granada» supone el final de las negociaciones entre FERNANDO el Católico y LUIS XII de Francia, en virtud de las cuales, FEDERICO I de Nápoles es desposeído del trono. La zona norte del reino quedará bajo la influencia francesa y todo el sur, bajo el poder español.