En los dibujos de la época difícilmente veremos a Colón desembarcando en América sin un fraile a su lado. Pero sólo en el segundo viaje los ha llevado. Son trece frailes de la orden de los mínimos de San Francisco de Paula. Cuando Colón llega a La Española (actual Santo Domingo) encuentra que el asentamiento de La Navidad ha sido arrasado y eliminados sus habitantes. Colón inicia de inmediato, un segundo asentamiento, La Isabela, más hacia el Este, que se convertirá  en punto de partida de las expediciones posteriores hacia el interior en busca de metales preciosos, a pesar de la resistencia indígena. En el trazado de la ciudad no falta el lugar para el templo en el que se oficia la misa por primera vez en América el 6.1.1494. Es entonces cuando Fray RAMON Pané, Fray Juan de Duela y Fray Juan Tisín se adentran en la selva para empezar la evangelización en tierras del cacique Guaticagua. Los Reyes Católicos dan a la conquista un gran sentido religioso. Envian a los misioneros «para que conviertan a los indígenas a nuestra santa fe católica», con la advertencia de que «se les trate amorosamente».

Tratado de Tordesillas: El monarca portugués JUAN II, no acepta la línea papal de demarcación -y esto demuestra que no existe la teoría del dominus orbi- y empieza una negociación diplomática entre Castilla y Portugal. Juan II propone que en vez de un meridiano se trace un paralelo, reservando a los portugueses la zona austral y dejando la septentrional para los españoles. Los REYES CATÓLICOS insisten en el meridiano y ofrecen correrlo más hacia el oeste: hasta 250 leguas e incluso 350 desde Cabo Verde, pero JIAN II sigue empeñado en que es necesario llevarlo más lejos, lo que hay que aceptar al fin. Se acuerda colocarlo a 370 leguas al oeste de Cabo Verde. El convenio se plasma en el Tratado de Tordesillas, firmado el 7 de junio de 1494. Las tierras descubiertas o que se descubran al oeste de dicha línea serán castellanas, y las situadas al este de la misma serán portuguesas. La nueva línea permitirá la ocupación de Brasil por parte de Portugal. El empeño del rey de este país por conseguir el paralelo, o al menos un meridiano tan alejado de Cabo Verde, se interpretará lógicamente como consecuencia de haber descubierto ya el Brasil, pues no se explica de otra manera.

El inquisidor TORQUEMADA, llevado por un exagerado celo y un obsesivo rigor, continúa la vigilancia y la persecución de los judíos que no se han convertido sinceramente e incluso se atreve a procesar, por simple sospecha de judaizar, a personas de las familias de los obispos de Segovia y de Calahorra. Su osadía desborda su propio poder. Estas dignidades apelan ante ALEJANDRO VI, el papa BORGIA, quien, el 23 de junio de 1494, nombra a tres nuevos inquisidores con la caritativa excusa diplomática de ayudar al enfermo y anciano inquisidor.

Tras un paseo triunfal por el norte de Italia, CARLOS VIII rey de Francia, hace su entrada triunfal en Roma. Los Colonna y los Orsini se pasan a los franceses. El Papa, ALEJANDRO VI, con los únicos tres mil hombres que permanecen fieles a él, se encierra en el castillo de Sant’Angelo, negándose a entregarse al victorioso rey francés. La decidida actitud del pontífice impresiona tanto al cristianísimo CARLOS, que éste se aviene a negociar con él. El acuerdo establece que el rey prestará juramento de obediencia y protección a la Santa Sede, permitiendo ésta, en compensación, el libre paso de los ejércitos franceses por los territorios de la Iglesia (lo que de todos modos hubiesen hecho porque no había fuerzas para oponérseles).

SAVONAROLA no puede ser infiel al monarca francés CARLOS VIII ya que éste encarna para él el azote del Señor anunciado en sus amenazadoras profecías. De este modo, la política de unión con Francia, que él ha propugnado y que tenazmente mantiene, le va a ser fatal, pues ALEJANDRO VI, no se detendrá hasta conducirlo a la hoguera.

A ALEJANDRO VI le preocupan menos las acusaciones que de continuo recibe de SAVONAROLA que la unión de éste con Francia, donde se encuentra refugiado el cardenal Giuliano della Rovere, el más peligroso enemigo del Papa, que presiona al rey CARLOS VIII para que propicie un Concilio y deponga al BORGIA por infiel y por herético.

Quiso la reina ISABEL premiar a Cisneros con el arzobispado de Toledo, pero conociendo la gran humildad de Cisneros no le dijo nada de sus propósitos y con gran secreto solicitó a Roma el nombramiento. Cuando se enteró Cisneros del caso huyó de la corte y se tuvo que enviar a hombres a caballo para que le alcanzasen y le entregasen las letras pontificias con su nombramiento. Tenía entonces sesenta años de edad, usaba el hábito franciscano, calzaba sandalias, dormía sobre una tabla, llevaba cilicio, iba siempre a pie, se levantaba con el sol y se alimentaba muy frugalmente, hasta el punto que se dice que sólo comía carne cuatro veces al año. Tuvo que intervenir el Papa para obligarle a que cambiara su vida por lo menos en lo exterior y Cisneros, obedeciéndole, contrató criados y viajó en litera, pero ni en Toledo ni en la corte la usó nunca, trasladándose siempre a pie. En Toledo fue muy bien acogido por el pueblo puesto que distribuía entre los pobres las cuantiosas rentas del arzobispado, pero el clero catedralicio protestó más de una vez y le quiso meter en cintura.

CARLOS VIII de Francia, en su invasión de Italia, superados ya los Estados Pontificios, conquista, en la fecha, sin demasiadas dificultades, el reino de Nápoles donde reina FERNANDO II de Nápoles. Entra en Nápoles, llevado por cuatro caballos blancos, sosteniendo en su mano el cetro y la corona imperial de Constantinopla. A continuación se proclama rey de Nápoles. El Papa ALEJANDRO VI se ve obligado a conferir a CARLOS VIII la investidura del reino de Nápoles. Y es que CARLOS VIII, en el caso de Nápoles, tiene ciertos derechos. En efecto, en el siglo XIII, un hermano de San Luis, Carlos de Anjou, conde de Provenza, había tomado el reino de Nápoles: Aventura, por lo demás, sin grandes consecuencias, pues los franceses habían sido expulsados, rápidamente, de Nápoles y de Sicilia por los aragoneses, tras la matanza de las Vísperas Sicilianas. Desde entonces, los reyes de Francia habían renunciado a la idea de una reconquista, pero sin abandonar sus derechos.

No son los florentinos los peores enemigos de SAVONAROLA, con ser muchos los perjudicados por la política de moralidad y austeridad que machaconamente propugna. El verdadero enemigo viene del exterior, de Roma: es el papa ALEJANDRO VI quien indiferente a las soflamas reformistas de SAVONAROLA, no permite que se interponga en sus planes políticos sobre Italia.

Los Reyes Católicos consiguen formar la Liga Santa con el destronado rey de Nápoles, el papa Alejandro VI y el emperador, contra el monarca francés Carlos VIII, que recientemente había tomado la ciudad del Vesubio.